Furthermore, we showed by quantitative PCR (qPCR) and immunohistochemistry that SLC2,1 was significantly over-expressed in ccRCC. The set of genes identified in this module furthers our understanding of the molecular basis and development of ccRCC.
Além disso, mostramos, por qPCR e imuno-histoquímica, a alta expressão de SLC2,1 foi significantemente alta em ccRCC. O conjunto de genes identificados neste estudo possibilita a compreensão das bases moleculares e de desenvolvimento do ccRCC.
Results: Among the 42 differentially expressed miRNAs identified in plasma obtained from patients with cancers of the liver, pancreas and biliary ducts, 28 miRNAs (67%) were shared between the three tumor subtypes, being 19 under-expressed and 9 over-expressed.
Resultados: Dos 42 miRNAs com expressão desregulada no plasma de pacientes com carcinomas HPB comparados ao grupo de indivíduos saudáveis, 28 miRNAs (67%) são compartilhados entre os três subtipos tumorais, sendo: 19 com expressão diminuída e 9 com expressão aumentada.
In Group B, 2 miRNAs were under- and 2 were over-expressed.
No Grupo B, 2 miRNAs apresentaram-se super- e 2 subexpressos.
This analysis allows for a quantification of total amount of a protein (and not restricted to an isoform), but it shows that these proteins were over-expressed. to various degrees, in the pancreatic tissues obtained from biopsies of PDA patients (Table I).
Essa análise permite uma quantificação da quantidade total de uma proteína (e não restrita a uma isoforma), mas mostra que essas proteínas foram superexpressas, em várias proporções, nos tecidos pancreáticos obtidos das biópsias de pacientes com PDA (Tabela I).
Results: 59 miRNAs were significantly over-expressed (FC>=1,5 and p<0,05) in AS. Of these, 21 miRNAs interact with 28 target genes with functions enriched for vascular development.
Resultados: 59 miRNAs estavam com expressão significativamente aumentada (FC>=1,5 e p<0,05) em AS. Destes, 21 miRNAs interagem com 28 genes-alvo enriquecidos para funções associadas ao desenvolvimento vascular.
Embodiments also include methods comprising the use of Specific Peptides conjugated or linked or bound to an antibody, antibody fragment, antibody-like molecule, or a molecule with a high affinity to a specific tissue marker, such as a cellular receptor, signal peptide or over-expressed enzyme, for targeting to the unwanted cellular elements.
As concretizações também incluem métodos compreendendo o uso de Peptídeos Específicos conjugados ou ligados ou unidos a um anticorpo, fragmento de anticorpo, molécula tipo anticorpo, ou molécula com alta afinidade por um marcador de tecido específico, tal como um receptor celular, peptídeo de sinal ou enzima superexpressa, para direcionamento aos elementos celulares indesejados.
Embodiments also include methods comprising the use of Specific Peptides conjugated or linked or bound to an antibody, antibody fragment, antibody-like molecule, or a molecule with a high affinity to a specific tissue marker, such as a cellular receptor, signal peptide or over-expressed enzyme, for targeting to the unwanted cellular elements.
As concretizações também incluem métodos compreendendo o uso de Peptídeos Específicos conjugados ou ligados ou unidos a um anticorpo, fragmento de anticorpo, molécula tipo anticorpo, ou molécula com alta afinidade por um marcador de tecido específico, tal como um receptor celular, peptídeo de sinal ou enzima superexpressa, para direcionamento aos elementos celulares indesejados.
Heat shock proteins (HSPs) are proteins present in cells under normal conditions and over-expressed in terms of stress and thermal shock.
As proteínas de choque térmico (HSPs) são proteínas presentes nas células em condições normais e supra-expressadas em condições de estresse e choque térmico.
...otein, virulence factors serine-protease subtilisins (Sub 3 and 5) and metalloproteases (Mep 3 and 4) and Hsp30. Additionally, among the 7,2 clones obtained in a library of lipid condition (72 h), 80 over-expressed transcripts were confirmed by cDNA dot-blot, revealing 14 unigenes similar to proteins of several pathogenic organisms, like glicoprotein 43 kD, MDR transporters, G protein, chitin synthase and serin...
... de virulência subtilisinas serino-proteases (Sub 3 e 5) e metaloproteases (Mep 3 e 4) e Hsp30. Adicionalmente, entre os 7,2 clones obtidos na biblioteca da condição lipídeo (72 h), 80 transcritos superexpressos foram confirmados por cDNA dot-blot, revelando 14 unigenes similares à proteínas de vários organismos patogênicos, como glicoproteína 43 kD, transportador MDR, proteína G, quitina sintase e serino/treonina fosfatase. Transcritos do gene TruMDR2, codificador de um transportador ABC, foi isola...
...otein interaction networks and miRNA-mRNA molecular pathways. Results: We identified 63 significantly deregulated (significantly deregulated is herein defined as FC≥2 and p<0,05) miRNAs in PDAC (33 over-expressed and 30 under-expressed) compared to paired histologically normal pancreatic tissue. In AMP, a group of 7 miRNAs was significantly deregulated (4 over-expressed and 3 under-expressed) compared to norm...
...alvo regulados por miRNAs, bem como redes de interação protéica e vias moleculares envolvendo genes e miRNAs. Resultados: Foram identificados 63 miRNAs desregulados em PDAC, sendo 33 com expressão aumentada e 30 com expressão diminuída, quando comparado com tecido histologicamente normal adjacente ao tumor. Nos carcinomas AMP, um grupo de 7 miRNAs estavam desregulados, sendo 4 com expressão aumentada e 3 com expressão diminuída. Nossos resultados indicam uma complexidade de alterações associadas à...
...l as, increased survival of the animals in 1,8 days with the reduction of the morbidity, which was evaluated by behavioral assay (SHIRPA). Considering the second purpose of this study, 10 miRNAs were over-expressed during the interaction of C. neoformans and U87-MG cells and it was noted that these miRNAs regulate the signaling pathway of TGF-β, MAP kinase (MAPK) and the receptor and matrix extracellula...
...rebro, pulmões e lavado broncoalveolar, assim como o aumento da sobrevida dos animais em 1,8 dias e redução da morbidade, a qual foi avaliada por ensaio de comportamento (SHIRPA). Diante da segunda proposta deste trabalho, foram encontrados 10 miRNAs super-expressos na interação de C. neoformans e células U87-MG e foi observado que os miRNAs regulam principalmente vias de sinalização TGF-β, MAP quinase (MAPK) e interação receptor e matriz extracelular (MEC). Tais dados foram cruzados com tr...
...nd DNA metabolism, such as DNA polymerase I (PolA), decreased following bovicin HC5 treatment while proteins involved in catabolism (TCA cycle) and chaperones (DnaK, GrpE, GroEL, ClpP, and ClpB) were over-expressed. The synthesis of important regulators (CodY and CcpA) also increased in the presence of the bacteriocin. These results indicate that bovicin HC5 and nisin can reduce bacterial adhesion in polymeric ...
...serem expostas à bovicina HC5. Proteínas envolvidas no catabolismo (ciclo do ácido tricarboxílico) e chaperonas (DnaK, GrpE, GroEL, ClpP e ClpB) apresentaram síntese aumentada. A síntese de importantes reguladores transcricionais (CodY e CcpA) também aumentou na presença da bacteriocina. Estes resultados indicam que bovicina HC5 e nisina podem diminuir a adesão bacteriana a superfícies poliméricas e, consequentemente, diminuir a formação de biofilmes, pela redução das características hidrofób...
...echanisms for understanding the release of BPPs from the precursor protein. Two constructs of the BPP precursor protein (BPP domain and BPP+CNP domains) from the venom gland of Bothrops jararaca were over-expressed. purified and the identity of both recombinant proteins confirmed by western blotting experiments. The purity of the samples was assessed by SDS-PAGE and the protein fold after expression was observe...
...te BPPs alinhados em tandem seguidos pelo peptídeo natriurético tipo-C. Até o momento, não se conhecem os mecanismos envolvidos para a liberação desses peptídeos da proteína precursora. Dessa forma, a resolução da estrutura dessa proteína pode contribuir para a elucidação do mecanismo evolvido no processamento do precursor para a liberação dos BPPs. Duas construções da proteína precursora de BPPs (domínio BPP e domínios BPP+CNP) da glândula de veneno de B. jararaca foram exp...
...rd A platform. Correlation analysis between miRNA expression in plasma and biopsy samples as well as among tissues derived from the distinct intestinal layers was performed. Results: miRNA let-7a was over-expressed (~7 fold higher) in plasma from patients with IND-B compared to controls. miRNA expression analysis in biopsy samples used the mucosal layer as reference control, since ganglion cells of the nerve pl...
...A Card A. Análise de correlação entre a expressão de miRNA em amostras de plasma e biópsia, bem como entre os tecidos derivados das camadas intestinais distintas foi realizada. Resultados: o miRNA let-7a foi superexpresso (~ 7 vezes mais) no plasma de pacientes com DNI-B em comparação com os controles. A análise da expressão do miRNA em amostras de biópsia utilizou a camada mucosa como controle, uma vez que as células ganglionares do plexo nervoso, que estão alteradas em pacientes com DNI-B...
...is using the BM cells of six patients. A comparison between RAEB and normal SAGE libraries show differentially expressed genes. Five under-expressed genes, TXNIP, SGPL1, NUMB, FOXO3 and MSH2 and five over-expressed genes, MIF, RHOG, ICAM3, CHI3,1 and NOTCH1, were selected for validation using real time PCR with samples collected at diagnosis and samples from the same patients collected six months after diagnosi...
...ra biblioteca SAGE de AREB, ao diagnostico, a partir de amostras de MO de seis pacientes. A comparação entre as bibliotecas AREB e normal evidenciou genes diferencialmente expressos. Cinco genes hipo-expressos, TXNIP, SGPL1, NUMB, FOXO e MSH2, e outros cinco hiper-expressos, MIF, RHOG, ICAM3, CHI3,1 e NOTCH1 foram selecionados para validação nas amostras coletadas ao diagnostico e dos mesmos pacientes após seis meses do diagnóstico, por PCR em tempo real. O padrão de expressão dos cinco genes hipo-exp...
...NA interaction networks and gateways involving genes and miRNAs. Results: 8 statistically significantly deregulated miRNAs (FC ≥1,5 and p <0,05) were identified in hepatocellular carcinoma, being 5 over-expressed and 3 under-expressed compared to histologically normal liver tissues. Our results showed a complexity of alterations associated with HCC tumorigenesis due to the number of target genes identified by...
... miRNAs. Resultados: Foram identificados 8 miRNAs com expressão diferencial estatisticamente significativa (FC ≥1,5 e p <0,05) em carcinoma hepatocelular, sendo que 5 miRNAs estavam com expressão aumentada e 3 miRNAs estavam com expressão diminuída comparado com os tecidos histologicamente normais. Nossos resultados mostram uma complexidade de alterações associadas à tumorigênese do CHC, devido ao número de genes-alvo identificados regulados pelos miRNAs alterados nesse tumor. Conclusão: Redes de ...
...ood. The gene function can be inferred mainly by the analysis of its expression pattern, the structure of the encoded protein and by the analysis of mutants where the gene is interrupted, silenced or over-expressed. For that purpose, our research group has developed transgenic lines by the insertion of a T-DNA construction that is based on the two-component iAc/Ds system of transposons. One of these lines shows...
...ipalmente pela análise de seu padrão de expressão, da estrutura da proteína codificada e pela análise de mutantes nos quais o gene se encontre interrompido, silenciado ou super-expresso. Para esse propósito, nosso grupo de pesquisa vem desenvolvendo linhagens transgênicas pela inserção de uma construção de T-DNA baseada no sistema de transposons de dois componentes iAc/Ds. Uma dessas linhagens (Ds72) apresenta estatura reduzida e sua inserção de T-DNA interrompe um locus, cuja função gênica ai...
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