Several technologies were created to make it easier to classify microorganisms, and with the emergence of high-throughput sequencing technologies this process has been hugely accelerated.
Diversas tecnologias foram criadas para facilitar a classificação, e com o surgimento das tecnologias de sequenciamento de alto rendimento. esse trabalho foi imensamente acelerado.
In addition, high-throughput sequencing coupled with bioacoustic data reveal that, as previously suspected, there are at least six different species being treated under the names I. guentheri or I. henselii.
Além disso, dados de sequenciamento de alto rendimento aliados a dados bioacústicos revelam que, como suspeitado anteriormente, há pelo menos seis espécies diferentes sendo tratadas sob o nome de I. guentheri ou I. henselii.
...f colonizing the common bean (Phaseolus vulgaris). Many endophytic microorganisms are known to benefit the host plant. To identify these microorganisms, one of the methods used is high-throughput sequencing. Some microorganisms can also harm host plants, such as the phytopathogenic fungus Colletotrichum lindemuthianum. This fungus is responsible for causing anthracnose in the common bean, causing losses in the productivity of thi...
...joeiro-comum (Phaseolus vulgaris). Muitos micro-organismos endofíticos são conhecidos por beneficiarem a planta hospedeira. Para identificar esses micro- organismos, um dos métodos utilizados é o sequenciamento de alto rendimento. Alguns micro-organismos também podem prejudicar as plantas hospedeiras, como o fungo fitopatogênico Colletotrichum lindemuthianum. Esse fungo é responsável por causar antracnose no feijoeiro-comum, ocasionando perdas na produtividade dessa cultura. Nos fungos fitopatogênicos, as enzimas que d...
...most abundant gene found in public database of genomes and metagenomes. This study evaluated the abundance and diversity of transposases from high-throughput sequencing data originated from two metagenomic libraries, one from soil with sugarcane cultivation and the other from forest soil. The metagenomes were analyzed through two research fronts. In the first one, transposases were identified in a set of 2,7. 8,9. 4,4 reads paire...
...am que a transposase é o gene mais abundante presente em banco de dados públicos de genomas e metagenomas. O presente estudo avaliou a abundância e diversidade de transposases a partir de dados de sequenciamento de alto rendimento provenientes de duas bibliotecas metagenômicas, a primeira originada de solo com cultivo de cana-de-açúcar e a segunda de solo de floresta. Os metagenomas foram analisados através de duas frentes de investigação. Na primeira frente de investigação foram identificadas as transposases em um c...
...ed. In addition a new genome belonging to the Dyella genus potentially involved with degradation of the lignocellulosic biomass were also uncovered. Overall, the results also corroborated the potential of high-throughput metagenomic sequencing and bioinformatic aproach for the elucidation of microbial communities with biotechnological potential, proving to be a valuable alternative for the bioenergy research....
... ao gênero Dyella, potencialmente relacionado com o processo de degradação da biomassa lignocelulósica. Em linhas gerais, os resultados obtidos também corroboraram o potencial que ferramentas de sequenciamento de alto rendimento. metagenômica e bioinformática apresentam para o estudo de comunidades microbianas com potencial biotecnológico, mostrando-se como uma valiosa alternativa para a investigação de novos alvos para a pesquisa em bioenergia....
...he soil has the potential to help to managing plant diseases. It was demonstrated that the microbiota associated with Andean soils has an important role in potato diseases suppressiveness. Based in this hypothesis we used high-throughput sequencing (HTS) and metabarcoding to investigate the composition, structure, and diversity of microbiota associated with the rhizosphere of native (landraces) and improved potatoes (commercial) ...
...ara o manejo de doenças de plantas. Foi demonstrado que a microbiota associada aos solos andinos tem papel importante na supressividade das doenças da batata. Com base nessa hipótese, utilizamos o sequenciamento de alto rendimento (SAR) e metabarcoding para investigar a composição, estrutura e diversidade da microbiota associada à rizosfera de batatas nativas e melhoradas dos Andes equatorianos para uma busca de potenciais agentes de controle biológico da PP. Os fungos encontrados foram predominantemente represent...
...growth, differentiation and death. The large diversity of miRNAs identified is restricted to a few species and only a fraction of the predicted miRNAs targets has been functionally characterized. The use of high throughput sequencing technology coupled with gene expression analysis by RT-qPCR enable the characterization of the microRNome. The Nile tilapia, Oreochromis niloticus, can be considered an excellent biological model for...
... diversidade de miRNAs identificados está restrita a poucas espécies e apenas uma parte do total de alvos de miRNAs preditos foi caracterizada funcionalmente. Nesse contexto, o uso da tecnologia de sequenciamento de alto rendimento (high throughput sequencing) atrelada à análise de nível transcricional por RT-qPCR possibilitam a identificação do microRNoma. A tilápia do Nilo, Oreochromis niloticus, é considerada um excelente modelo biológico para o estudo de miRNAs em vertebrados devido à sua importância econômica ...
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