Região (ou átomo) específica em uma entidade molecular que é capaz de entrar em uma interação estabilizadora com outra entidade molecular; um exemplo dessa interação éseria a de um sítio ativo em uma enzima com seu substrato.
Meaning
A specific region (or atom) in a molecular entity that is capable of entering into a stabilizing interaction with another molecular entity. An example of such an interaction is that of an active site in an enzyme with its substrate.
Exemplos de tradução
Comparison of the amino acid sequence of Leishmania (V.) braziliensis (6-FGL) enzyme with T. brucei showed the conservation of residues at the Leishmania T. brucei enzyme binding site.
A comparação da sequência de aminoácidos da enzima (6-FGL) do Leishmania (V.) braziliensis com do T. brucei apontou a conservação dos resíduos presentes no sítio de ligação da enzima do T. brucei do Leishmania.
Banco de Glossários (traduções não verificadas)
Área
Inglês
Português
Qualidade
Téc/Geral
binding site
sítio de ligação
Medicina
Antigen binding site
sítio de ligação de antígeno
Téc/Geral
binding site
local (e não sítio!) de ligação
Téc/Geral
monosaccharide binding site
sítio de ligação de monossacarídeo
Medicina
ATP-binding site
sítio de ligação de ATP; sítio fixador de ATP
Frases traduzidas contendo "sítio de ligação"
However, crop tolerance mechanisms are observed, such as differences in absorption, translocation and degradation before the herbicide reaches the target site.
Geralmente, o mecanismo de resistência aos herbicidas inibidores da ALS é considerado como insensibilidade da enzima ao herbicida, ou seja, a alguma alteração no sítio de ligação herbicida-enzima.
We observed that rosiglitazone does not occupy the whole binding pocket and there is a complementarity between ligand and receptor.
Observamos que a rosiglitazona não ocupa todo o sítio de ligação. havendo uma complementaridade entre o ligante e o receptor na base do domínio de ligação.
Comparison of the amino acid sequence of Leishmania (V.) braziliensis (6-FGL) enzyme with T. brucei showed the conservation of residues at the Leishmania T. brucei enzyme binding site.
A comparação da sequência de aminoácidos da enzima (6-FGL) do Leishmania (V.) braziliensis com do T. brucei apontou a conservação dos resíduos presentes no sítio de ligação da enzima do T. brucei do Leishmania.
In addition, nPELa has a metal binding site and a conserved carbohydrate recognition domain, in a similar way to what was shown by other Dalbergieae tribe lectins, such as PAL (Pterocarpus angolensis) and CTL (Centrolobium tomentosum).
Além deste, nPELa apresenta um sítio de ligação a metais e um domínio de reconhecimento a carboidratos conservados, semelhantes ao demonstrado para outras lectinas da tribo Dalbergieae, como PAL (Pterocarpus angolensis) e CTL (Centrolobium tomentosum).
Moreover, the product inhibition is related to conformational changes of residues located close to the substrate binding site.
Observou-se também que a inibição por produto está relacionada a alterações conformacionais de resíduos próximos ao sítio de ligação.
A compound with an imidazopyridine ring in which the binding site for the functional group is a carbon atom other than the carbon at 6-position can be obtained by using a compound with a pyridine ring to which iodine is bonded at a different site instead of 2-amino-5-iodopyridine used in FIG. 2,1, Step 2.
Um composto com um anel de imidazopiridina em que o sítio de ligação para o grupo funcional é um átomo de carbono que não o carbono na posição 6 pode ser obtido usando um composto com um anel de piridina ao qual iodo é ligado em um sítio diferente em vez da 2-amino-5-iodopiridina usada na FIG. 2,1, Etapa 2.
The obtained system ZnCdTe-ConBr was subjected to various analyzes such as particle size by Dynamic Light Scattering (DLS); evaluation of optical properties by UV/Visible Spectroscopy Absorption (UV/Vis) and photoluminescence spectroscopy; chemical evaluation of bioconjugation by Infrared Spectroscopy (FT-IR); assessment of morphology and microcomposition by Scanning Electron Microscopy (SEM); topographical evaluation, mechanical and physicochemical properties by Atomic Force Microscopy (AFM); and evaluation of lectin carbohydrate binding site integrity for haemagglutinating activity (H. A.).
O sistema obtido ZnCdTe-ConBr foi submetido a diversas análises como: tamanho de partícula por Espalhamento Dinâmico de Luz (DLS - Dynamic light scattering); avaliação das propriedades óticas por Espectroscopia de Absorção Ultravioleta/Visível (UV/Vis) e Espectroscopia de Fotoluminescência; avaliação química da bioconjugação por Espectroscopia no Infravermelho (FT-IR - Fourier Transform InfraRed); avaliação da morfologia e microcomposição por Microscopia Eletrônica de Varredura (MEV); avaliação topográfica, propriedades mecânicas e físico-químicas por Microscopia de Força Atômica (AFM - Atomic Force Microscopy); e avaliação da integridade do sítio de ligação à carboidratos por Atividade Hemaglutinante (A. H.).
However, the pro-r-DGL showed no affinity for galactose or lactose, showing that the topology of the binding site and the conformation of the loops that structure, the main specificity determinants of the monosaccharides.
Entretanto, a r-pro-DGL não apresentou afinidade por galactose ou lactose, demonstrando ser a topologia do sítio de ligação. bem como a conformação das alças que os estruturam, os principais fatores determinantes da especificidade a monossacarídeos.
When the linker is a peptide linker, the linkage may take place at a certain linking site.
Quando o ligante é um peptídeo de ligação, a ligação pode ocorrer em um certo sítio de ligação.
A compound with an imidazopyridine ring in which the binding site for the functional group is a carbon atom other than the carbon at 6-position can be obtained by using a compound with a pyridine ring to which bromine is bonded at a different site instead of 2-amino-5-bromopyridine used in Step 2.
Um composto com um anel de imidazopiridina em que o sítio de ligação para o grupo funcional é um átomo de carbono que não o carbono na posição 6 pode ser obtido usando um composto com um anel de piridina ao qual o bromo é ligado em um sítio diferente em vez da 2-amino-5-bromopiridina usada na Etapa 2.
These activities are associated with the carbohydrate binding site.
Estas atividades estão associadas ao sítio de ligação a carboidratos.
How amicarbazone is a photosynthesis inhibitor herbicide is needed to reach the chloroplasts of leaf cells to act in its binding site in photosystem II. As a consequence of the interruption of electron transport in photosystem II is an increase in fluorescence produced, besides the formation of free radicals that lead to plant death.
Como o amicarbazone é um herbicida inibidor da fotossíntese torna-se necessário que alcance os cloroplastos das células das folhas para atuar em seu sítio de ligação no fotossistema II. Como conseqüência da interrupção do transporte de elétrons no fotossistema II ocorre um incremento na fluorescência produzida, além da formação de radicais livres que levam a planta à morte.
Extraction experiments suggest that benzene, pyridine and dibenzothiophene do not compete for the same hydrogen bond sites of the IL.
Experimentos de extração sugerem que benzeno, piridina e DBT não competem para o mesmo sítio de ligação no LI.
It was also considered the relevance of the screening of the next-closed residues with interact with the ligands, and it was performed an analysis of the interaction energy between the focused residues (close and next-closed) with the atoms of the ligands (results depicted in the BIRD panels), without and with the mediation of water molecules existing in the binding pocket (which allows to determine ab initio the relevance of water in the GluR2-ligands energetic).
Considerou-se também a relevância da blindagem dos resíduos pós-próximos que interagem com os ligantes, bem como se fez uma análise da energia de interação dos resíduos (próximos e pós-próximos) considerados com os átomos dos ligantes (resultados apresentados nos gráficos BIRD), sem e com mediação das moléculas de água existentes no sítio de ligação (o que permite se determinar ab initio a relevância da água na energética da interação ligante-GluR2).
In addition, this study shows that AABA can take different provisions in its binding site.
Além disso, esse estudo mostra que o AABA pode assumir diferentes disposições em seu sítio de ligação.
A compound with an imidazopyridine ring in which the binding site for the functional group is a carbon atom other than the carbon at 6-position can be obtained by using a compound with a pyridine ring to which bromine is bonded at a different site instead of 2-amino-5-bromopyridine used in Step 2.
Um composto com um anel de imidazopiridina em que o sítio de ligação para o grupo funcional é um átomo de carbono que não o carbono na posição 6 pode ser obtido usando um composto com um anel de piridina ao qual o bromo é ligado em um sítio diferente em vez da 2-amino-5-bromopiridina usada na Etapa 2.
Arcaine is a competitive antagonist of the polyamine binding site at the NMDA receptor which induces state-dependent recall.
A arcaína é um antagonista do sítio de ligação das poliaminas no receptor NMDA, a qual induz dependência de estado.
Despite the high structural similarity, small changes in the direction of key amino acids may be responsible for the diversity in the biological applications as a result of the residues of the carbohydrate binding site which are retained despite changes in spatial orientation.
Apesar da alta similaridade estrutural, pequenas mudanças na orientação de aminoácidos chaves, podem ser responsáveis pela diversidade nos resultado de aplicações biológicas como os resíduos do sítio de ligação a carboidrato, que apesar de conservados possuem modificações na orientação espacial.
Homology modeling generated reliable models that after undergoing molecular docking studies evidenced a probable oxalate binding site involving three histidine and one glutamate residues.
A modelagem por homologia gerou modelos confiáveis que ao serem submetidos a estudos de docking molecular evidenciaram um provável sítio de ligação ao oxalato, envolvendo três resíduos de histidina e um de glutamato.
Conserved regions of the Sobemovirus gender had also been identified such as Coat Protein binding site (CPBS), serine protease catalytic triad (H-D-S) and heptanucleotide sequence (TTTAAAC).
Regiões conservadas do gênero Sobemovirus também foram identificadas, tais como sítio de ligação à Capa Protéica (CBPS), a tríade catalítica da serino protease (H-D-S) e a seqüência de heptanucleotídeos (TTTAAAC).
The frutalin binding site cavity is near the N-terminus of the α chain formed by four key residues Gly25, Tyr1,6, Asp1,9, and Trp1,7.
O sítio de ligação da Frutalina consiste numa cavidade próxima ao N-terminal da cadeia α, formada por quatro resíduos-chave: Gly25, Tyr1,6, Trp1,7 e Asp1,9.
Now with the structure resolved, can observe the binding siti of protein and amino acids to identify which part of the same; calculate the avarage RMSD betweem the native and complexed structures with the sugar manose 1,6 manose; compare the binding sites of CGL and CML proteins complexed with sugars man 1,2 man, man 1,3 man, man 1,4 man and man 1,6 man.
Já com a estrutura resolvida, pode-se observar o sítio de ligação da proteína e identificar quais aminoácidos fazem parte do mesmo; calcular o RMSD médio entre as estruturas nativa e complexada com o açúcar manose 1,6 manose; comparar os sítios de ligação das proteínas CGL e CML complexadas com os açúcares man 1,2 man, man 1,3 man, man 1,4 man e man 1,6 man.
By docking we found that, SRVIC22 and SRVIC32 can interact with the protein in ATP ligation site and although they do not present the higher values of docking score, some physical- chemical characteristics help to explain they better in vitro activity.
Através do docking vimos que o SRVIC22 e SRVIC32 podem interagir com a proteína no seu sítio de ligação de ATP e, embora não apresentem os maiores valores de docking score, algumas características físico-químicas ajudam a explicar sua melhor atividade in vitro.
We also found that these and other changes induce the water entrance in the binding site.
Além disso, verificou-se que essas e outras mudanças induzem a entrada de água no sítio de ligação.
In addition, it was possible to confirm the Fc portion as the preferred binding site of IGBP-C in IgG. The homology modeling of this protein was done for a better understanding of its function and finally, IGBP-C has also been shown to interfere with the angiogenesis process, as well as in the activation of the classical complement pathway.
Além disso, foi possível confirmar a porção Fc como o sítio de ligação preferencial da IGBP-C na IgG. Por fim, para um maior entendimento da sua função, foi feita a modelagem por homologia da IGBP-C e em ensaios adicionais, visto que essa proteína também interfere no processo de angiogênese, bem como na ativação da via clássica do complemento.
A compound with an imidazopyridine ring in which the binding site for the functional group is a carbon atom other than the carbon at 6-position can be obtained by using a compound with a pyridine ring to which iodine is bonded at a different site instead of 2-amino-5-iodopyridine used in FIG. 2,1, Step 2.
Um composto com um anel de imidazopiridina em que o sítio de ligação para o grupo funcional é um átomo de carbono que não o carbono na posição 6 pode ser obtido usando um composto com um anel de piridina ao qual iodo é ligado em um sítio diferente em vez da 2-amino-5-iodopiridina usada na FIG. 2,1, Etapa 2.
However, the pro-r-DGL showed no affinity for galactose or lactose, showing that the topology of the binding site and the conformation of the loops that structure, the main specificity determinants of the monosaccharides.
Entretanto, a r-pro-DGL não apresentou afinidade por galactose ou lactose, demonstrando ser a topologia do sítio de ligação. bem como a conformação das alças que os estruturam, os principais fatores determinantes da especificidade a monossacarídeos.
...as crystallized by vapor diffusion method in the presence of α-methyl-D-mannoside. The lectin also showed average toxicity against artemia nauplii and induced paw edema and hypernociception in mice with the participation of the carbohydrate binding site. In tests on C6 lineage of Rattus norvegicus glioma cells, Cvill showed ability to reduce viability and changes in morphology in the cells tested....
... de vapor na presença do ligante α-metil-D-manosídeo. Essa lectina mostrou alta toxicidade contra náuplios de Artemia sp., induziu edema de pata e hipernocicepção em ratos com participação do sítio de ligação a carboidratos e mostrou efeitos citotóxicos em células de glioma da linhagem C6 com uma potente atividade na redução da viabilidade celular e alteração na morfologia celular....
...s was also tested, demonstrating an excellent antiproliferative profile. Some of these molecules inhibited tubulin, apparently in the binding site of colchicine. Lastly, it is possible to affirm that this work provided the synthesis and biological evaluation of new spiro molecules, which hereafter may serve as prototype for the design of new antibacterial and/or antitumor drugs...
...o. A atividade antitumoral das espiro-hexadienonas sintetizadas também foi testada, demonstrando um excelente perfil anti-proliferativo. Algumas dessas moléculas inibem a tubulina, aparentemente no sítio de ligação da colchicina. Por fim, é possível afirmar que este trabalho permitiu a síntese e avaliação biológica de novas moléculas espiro, que futuramente poderão servir como protótipos para o desenho de novos fármacos antibacterianos e/ou antitumorais...
...) for 30 minutes. SPD (0,5 and 1 μM) decreased Na+,K+-ATPase activity in slices, but not in homogenates. MK-8,1 (1,0 μM), a non-competitive antagonist of NMDA receptor, arcaine (0,5 μM), an antagonist of the polyamine binding site at the NMDA receptor, and L-NAME (1,0 μM), a nitric oxide synthase inhibitor, prevented the inhibitory effect of SPD (0,5 μM). ODQ (10 μM), a guanylate cyclase inhibitor, and KT58,3 ...
... diminuíram a atividade da Na+,K+-ATPase em fatias, mas não no homogeneizado de hipocampo. MK-8,1 (1,0 μM), um antagonista não competitivo do receptor NMDA, arcaína (0,5 M), um antagonista do sítio de ligação das poliaminas no receptor NMDA, e L-NAME (1,0 μM), um inibidor da NOS, preveniram o efeito inibitório da SPD (0,5 M). ODQ (10 μM), um inibidor da enzima guanilato ciclase, e KT58,3 (2 μM), um inibidor da proteína quinase dependente de GMPc, também preveniram o efeito inibitório da SPD so...
...usand human genomes. Out of eight novel or rare DNA variants, four were detected in patients for whom a pathogenic mutation had been found. Two and one additional DNA point variants from the same patient flanked a putative transcription factor binding site. Finally, a novel DNA variant residing in the TSC1 noncoding exon 2 was predicted to change the sequence potential to behave as a splicing enhancer. In summary, s...
...ctadas em pacientes para os quais uma mutação patogênica havia sido identificada e, por isso, foram reclassificadas como polimorfismos. Duas e uma variantes de DNA do mesmo paciente flanqueavam um sítio de ligação em potencial para um fator de transcrição específico, a 5' do promotor basal de TSC1. Por fim, uma nova variante de DNA na região não codificadora do éxon 2 do gene TSC1 foi predita com potencial para alterar um elemento candidato a acentuador de splicing. Em resumo, como observado em estudos...
...g the oxidative burst. Since the FcgRIIIb/CR3 cooperation occurs via lectin-sacharide-like interaction, the aim of this study was to evaluate whether the allelic polymorphism, NA1 and NA2, could influence the cooperation of FcgRIIIb with CR3 in mediating the oxidative burst of neutrophils. FcgRIIa and FcgRIIIb genotyping analysis were performed by polymerase chain reaction with allelespecific primers and surface exp...
... celular. A cooperação entre os FcgRIIa/IIIb com o CR3 promove a estimulação máxima das respostas do neutrófilo, dentre elas o burst oxidativo. Uma vez que a interação FcgRIIIb/CR3 ocorre via sítio de ligação lectina-sacarídeo, o objetivo deste estudo foi avaliar se o polimorfismo alélico do FcgRIIIb poderia afetar a cooperação entre os FcgR e os CR em mediar o burst oxidativo dos neutrófilos. As freqüências dos alelos H/R-1,1 e NA1/NA2/SH foram analisadas por genotipagem com oligonucleotídeos a...
...nyltetrazolium bromide)] test and Methylation Specific – Polymerase Chain Reaction (MS-PCR) was used to verify the possible hypomethylation effect of p-coumaric acid, EGCG and EEP three breast cancer cell-lines (BT-5,9, MDA-MB-2,1 and MDA-MB-4,6). Our results indicates that CAPE, (2E, 6Z)-farnesol and p-coumaric acid were the ligands that showed more negative free binding energies, better occupation of the binding...
...er de mama. Os nossos resultados de docking indicaram que CAPE, (2E,6Z)-farnesol e o ácido p-cumárico foram os ligantes que apresentaram energias de ligação mais favoráveis, melhor ocupação do sítio de ligação e interações químicas comuns com o complexo SAH-DNMT1. O EEP reduziu a viabilidade celular das linhagens BT-20 e BT-5,9, enquanto o ácido p-cumárico e EGCG reduziram a viabilidade de todas as linhas celulares estudadas, de um modo dose e tempo dependentes. Tanto o EGCG como o ácido p-cumáric...
... a tetrameric arrangement and presents as a dimer in the asymmetric unit suggests a crystal packing similar to other lectin subtribe Diocleinae, D. guianensis, D. rostrata, regarding the carbohydrate-binding site and contacts dimeric....
...rico e se apresenta como dímero na unidade assimétrica sugerindo um empacotamento cristalino similar a outra lectina da subtribo Diocleinae, D. guianensis, D. rostrata, a respeito do sítio de ligação a carboidrato e os contatos diméricos....
...cing by Perez et al. (19,1) are now determinated as I17, I53, S1,9, S1,4, G1,4, S1,4, P1,5, S1,7, V1,0, S1,9, T1,6 and S2,2. These modifications confer 98% of similarity between ConM, ConA and ConBr. ConM structure presents a high level of tertiary protein folding, typically of legume lectins. Despite the specificity and the numbers of hydrogen bonds formed in the interaction with the disaccharides maltose and treha...
...am para 98% o grau de similaridade entre as duas lectinas. A estrutura de ConM nativa exibe um alto grau de enovelamento terciário, típico das lectinas de leguminosas, com visível conservação do sítio de ligação a metais e loops envolvidos na oligomerização molecular. Embora a especificidade e o número de pontes de hidrogênio formadas na interação com os dissacarídeos maltose e trealose seja a mesma, estruturalmente ocorrem diferenças no padrão de formação de pontes de hidrogênio, principalment...
...enzyme has its activity inhibited by the presence of the calcium ion which, in opposite, is important for heparinanses I and III activities. The heparinase II is a glycoprotein and shows a zinc ion binding site, which plays an important role in the protein structure maintenance. Thus, the current work aims to characterize the structure and conformation of heparinase II enzyme and, based on this information, support ...
...a atividade inibida pela presença do íon cálcio que, em contrapartida, é importante para a atividade das heparinases dos tipos I e III. A heparinase II é uma glicoproteína e apresenta um sítio de ligação ao íon zinco, o qual exerce uma importante função de manutenção da integridade da estrutura protéica. Desta forma, o presente trabalho tem por objetivo a caracterização estrutural e conformacional da enzima heparinase II e, a partir destas informações, subsidiar o entendimento do reconhec...
...suberin and cuticle, as well as acts as an intermediary for the synthesis of some flavonoids. Through further analysis in the OsABCB17 mutant, a gene of the ABC family, was verified the existence of a different site of connection indicating to be a possible carrier of ferulic acid. The ABC transporters are members of a protein family with ability to bind and hydrolyze ATP. The ATP is used as source of energy ...
...ula, atuando também como intermediário na síntese de alguns flavonoides. Por meio de análises posteriores em mutantes do gene OsABCB17, um gene da família ABC, foi verificado a existência de um sítio de ligação diferente dos demais, indicando ser um possível transportador de ácido ferúlico. Os transportadores ABC são membros de uma família protéica que possuem a habilidade de se ligar e hidrolisar ATP como fonte de energia para dirigir o transporte através da membrana plasmática, podendo funcionar...
...)indol-3-yl]-4-(indol-3-yl) maleimide hydrochloride (GF 1092,3X, 0,3 - 30 ρg/site); the antagonist of the polyamine-binding site at the NMDA receptor, arcaine (0,2 - 2,0 ρmol/site) or the PKC activator, phorbol 12-myristate 13-acetate (PMA, 0,02 - 2 nmol/site) were injected intra-hipocampally (i.h.). Testing was carried out in the same apparatus, twenty-four hours after reactivation. Freezing scores at testing wer...
...am administradas, por via ih, espermidina (2,200 ρmol/sítio); o inibidor da PKC, 3- [1- (dimetilaminopropil) indol-3-il] -4- (indol-3-il) maleimida (GF 1092,3X, 0,3-30 ρg/sítio); o antagonista do sítio de ligação das poliaminas no receptor de NMDA, arcaína (0,2-2,0 ρmol/sítio) ou o ativador de PKC, 12-miristato 13-acetato de forbol (PMA, 0,02-2 nmol/sítio). Os testes foram realizados no mesmo aparelho, 24 horas após a sessão de reativação. O tempo de imobilidade dos animais durante o teste foi consi...
... a tetrameric arrangement and presents as a dimer in the asymmetric unit suggests a crystal packing similar to other lectin subtribe Diocleinae, D. guianensis, D. rostrata, regarding the carbohydrate-binding site and contacts dimeric....
...rico e se apresenta como dímero na unidade assimétrica sugerindo um empacotamento cristalino similar a outra lectina da subtribo Diocleinae, D. guianensis, D. rostrata, a respeito do sítio de ligação a carboidrato e os contatos diméricos....
... ability to bind in vitro to chitin and in vivo to chitin structures of the midgut of larvae. In addition, the conservation in other 7S globulins of many of the residues constituting the β-vignin chitin binding site as predicted in this paper also supports previous hypotheses that have shown that the vicillins of other legume species can also bind to chitin. The results of the present work provide the first descrip...
...acidade de se ligar in vitro à quitina e in vivo a estruturas quitinosas do intestino médio das larvas. Além disso, a conservação em outras globulinas 7S de muitos dos resíduos que constituem o sítio de ligação a quitina de β-vignina, como previsto neste módulo, também suporta as hipóteses anteriores que mostraram que as vicilinas de outras espécies de leguminosas também podem se ligar à quitina. Os resultados do presente trabalho fornecem a primeira descrição do mecanismo molecular envolvido na ...
...plasts. Thus, the objective of this study was to evaluate the inhibition of the eletrons flow in PSII and the intoxication level of weeds and different sugarcane varieties treated with amicarbazone. In a first experiment, carried out under field conditions, it were evaluated the effects of amicarbazone on the growth and the eletron transport rate (ETR) of three sugarcane varieties PO88,2, SP80,3280 and RB83,5486. ET...
...da fotossíntese, e atua mais especificamente sobre a taxa de transporte de elétrons no fotossistema II (FSII) sendo necessário que alcance os cloroplastos das células das folhas para atuar em seu sítio de ligação. Dessa forma, o objetivo deste trabalho foi avaliar a ação do amicarbazone no FSII e a fitointoxicação de plantas daninhas e de três variedades de cana-de-açúcar submetidas a aplicação deste herbicida. O trabalho foi desenvolvido em dois experimentos, sendo que no primeiro estudo foram ava...
...MD) Simulation are used to study two important NRs LBD: Thyroid Hormone Receptor (TR) and Estrogen Receptor (ER). Studies involving TR began by investigating a new second binding site of thyroid hormones (T3 and T4) in the TR LBD. It has been shown that hormones remain anchored to the second site and have high mobility and multiple binding modes. Estimates of dissociation DG indicate that this new site can ex...
... o estudo do LBD de dois importantes NRs: Receptor do Hormônio Tireoideano (TR) e Receptor de Estrogênios (ER). Os estudos envolvendo o LBD do TR iniciaram-se pela investigação de um novo segundo sítio de ligação dos hormônios tireoideanos (T3 e T4). Foi mostrado que os hormônios se mantêm ancorados ao segundo sítio, possuindo grande mobilidade e múltiplos modos de ligação. Estimativas do DG de dissociação indicam que este novo sítio deve existir em solução aquosa, sendo T4 o hormônio com maior...
...gamete-specific methylation acts as an insulator by precluding CTCF binding in the paternal allele. A previous literature report have suggested that only the sixth CTCF-binding site shows parental specific methylation. This finding was correlated with the imprinting expression pattern of IGF2 and H19 genes in bladder cancer. In the present study, the allele-specific methylation pattern of the H19 gene was evaluated ...
... contém sete regiões de ligação da proteína CTCF (proteína bloqueadora do acentuador), que é sensível à metilação do DNA. Um relato prévio da literatura sugeriu que somente o sexto sítio de ligação do fator CTCF apresenta metilação parental específica. Este achado foi correlacionado com o padrão de expressão regulado por imprinting dos genes IGF2 e H19 em câncer de bexiga. No presente estudo, o padrão de metilação alelo-específico do gene H19 foi determinado em duas regiões distint...
...mined by a GTP-binding blot assay. The S-64 protein binds GTP, rather than ATP, because the E. coli produced S-64 was radiolabeled by [ 32 Pα]- GTP in the presence of large excess of unlabeled ATP competitor. The GTP binding site was delimited by loss of function assays in which the ability of site directed mutants to retain the GTP binding activity was evaluated. In fact, mutation in the putative GTP/ATP bi...
...iga-se à GTP, preferencialmente à ATP, uma vez que uma versão de S-64 produzida em E. coli foi marcada radioativamente por [ 32 Pα]-GTP, na presença de ATP não marcado como competidor. O sítio de ligação à GTP foi delimitado pelo teste de perda de função a partir de mutação dirigida in situ. De fato, mutação no putativo sítio de ligação a ATP/GTP bloqueia a referida atividade da proteína. Tais resultados estabelecem que a proteína S-64 é, de fato, uma proteína de ligação à GTP asso...
...II site on the HSA. In addition, when binding to the protein, DanGly acquires chirality, a feature that can also be used to characterize the binding site of new compounds in albumin. This work aimed to elucidate the induction of chirality in the DanGly by its bonding to the HSA. Experimental Electronic Circular Dichroism (ECD) spectra of DanGly (1,0 μM) in the absence or presence of HSA (30 μM) in 50...
...rcador fluorescente específico para o sítio II na HSA. Além disso, ao se ligar à proteína, a DanGly adquire quiralidade, uma característica que também pode ser usada para caracterizar o sítio de ligação de novos compostos na HSA. Este trabalho teve como objetivo elucidar a indução de quiralidade na DanGly por sua ligação com a HSA. Os espectros de Dicroísmo Circular Eletrônico (ECD) da DanGly (1,0 μM) na ausência ou presença de HSA (30 μM) em solução fosfato de sódio 50 ...
...ys previously associated with diseases but also corroborating the behavior of novel candidate genes with the real-time PCR technique. The hunT program has identified 4,602 mouse genes containing the binding site for the T domain, some of which have already been demonstrated experimentally. We identified 32 of these genes with altered expression in a study which evaluated the transcriptome of in vitro differentiation...
... previamente associados às doenças e da validação de novos genes candidatos através da técnica de PCR quantitativo em tempo real. Já o programa hunT identificou 4,602 genes de camundongo com o sítio de ligação para o domínio do T, sendo alguns deles já demonstrados experimentalmente. Identificamos 32 destes genes com expressão alterada em um estudo onde avaliamos o transcriptoma da diferenciação in vitro de células tronco embrionárias de camundongo para mesoderma, sugerindo a participação destes...
...of NMDARs, have been shown to have both concentration and synthesis increased by Aβ. Using the novel object recognition task we showed that negative modulation of polyamine system, been trough blockade of its binding site at NMDAR by arcaine (0,02 nmol/site), traxoprodil (0,002 nmol/site), or inhibition of polyamine synthesis by DFMO (2,7 nmol/site), reverses Aβ25,35-induced memory impairment in mice. The activati...
...da tanto no cérebro de pacientes com DA como em preparações in vitro utilizando o peptídeo Aβ. Neste estudo demonstrou-se que a modulação do sistema das poliaminas, através do bloqueio do seu sítio de ligação no receptor NMDA por arcaína (0,02 nmol/sítio), traxoprodil (0,002 nmol/sítio) ou da inibição de sua síntese por DFMO (2,7 nmol/sítio), reverte o déficit cognitivo induzido pela injeção de Aβ25,35 em camundongos testados na tarefa de reconhecimento de objetos. A ativação do sítio de l...
... cancer cells, HIV-I and HIV- II and against growth of bacterial biofilms. The sequence when compared to databases (NCBI) showed homology to lectins belonging to the family OAAH. The results have shown that AML is a protein of OAAH family with four repeated domains in its aminoacid sequence as well as a conserved carbohydrate binding site with high identity with the lectins of OAAH family. AML is the first le...
...ML, associada às suas características físico-químcas, comprovou que ela é mais uma integrante da família OAAH que possui quatro domínios repetidos na sua sequência de aminoácidos além de um sítio de ligação a carboidrato conservado e com alta identidade com os das lectinas da família OAAH. A AML foi capaz de reduzir a viabilidade celular de células de câncer colorretal e de reduzir o número de células viáveis de S. aureus e E.coli. Apresentou atividade contra vírus HIV em concentr...
... correlation within its results, regardless the scoring function used. The leading inhibitors structures had in common a high stabilization of ligand-enzyme complex due hydrophobic interactions, something expected due polarity of the enzyme binding site....
... função de avaliação utilizada. Observou-se que as melhores estruturas em termos de inibição possuíam uma quantidade razoável de interações hidrofóbicas, de modo a manterem-se estáveis no sítio de ligação da enzima que possui baixa polaridade....
...the sGC. Conclusions: This compound prevented the gastric damage induced by naproxen in mice, through increased cGMP levels, decreased leukocyte adhesion and rolling, and still due to maintenance of gastric blood flow, with the binding site independent of ODQ, in sGC....
...ração de naproxeno 3,0 mg/Kg em camundongos, por meio do aumento dos níveis de GMPc, diminuição da adesão leucocitária, e ainda devido à manutenção do fluxo sanguíneo gástrico por meio de sítio de ligação independente do ODQ, presente na enzima GC solúvel....
...ergillus niger, as well as with two Xgh similar enzymes of Aspergillus fumigatus. Multiple alignment revealed that XghCp presents a GIK sequence (Gly-lle-Lys), common to all endoxylogalacturonan known hydrolases, in the region corresponding to the polygalacturonase substrate binding site. This is the first report of an endoxylogalacturonan hydrolase in a basidiomycete. Cloning and characterization of palA and pacC, ...
...nana hidrolase de Aspergillus tubingensis, Aspergillus niger e
duas enzimas similares a Xgh de Aspergillus fumigatus. O alinhamento múltiplo revelou que XghCp apresenta, na região correspondente ao sítio de ligação ao substrato de poligalacturonase, a seqüência GIK (Gy-Ile-Lys) que foi comum a todas as endo-xilogalacturonanas hidrolase analisadas. Este é o primeiro relato de endo-xilogalacturonana hidrolase em basidiomiceto. neste módulo também foi realizada a clonagem e caracterização dos genes palA e...
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