In another embodiment, Y can be an amino acid sequence including at least a portion of the C-terminal region of the human IgD hinge region (amino acid residues at positions 99 to 1,2 of SEQ ID NO: 14), p can be 1 or 0 (zero), Z2 can be an amino acid sequence including at least a portion of the N-terminal region of the human IgD CH2 domain (amino acid residues at positions 1,3 to 1,9 of SEQ ID NO: 14), and Z3 can be an amino acid sequence including at least a portion of the C-terminal region of the human IgG4 CH2 domain (amino acid residues at positions 1,1 to 2,0 of SEQ ID NO: 13).
Em outra concretização, Y pode ser uma sequência de aminoácidos incluindo pelo menos uma parte da região C-terminal da região de dobradiça da IgD humana (resíduos de aminoácidos nas posições 90 a 1,2 da SEQ ID NO: 14), p pode ser 1 ou 0 (zero), Z2 pode ser uma sequência de aminoácidos incluindo pelo menos uma parte da região N-terminal do domínio CH2 da IgD humana (resíduos de aminoácidos nas posições 1,3 a 1,9 da SEQ ID NO: 14), e Z3 pode ser uma sequência de aminoácidos incluindo pelo menos uma parte da região C-terminal do domínio CH2 da IgG4 humana (resíduos de aminoácidos nas posições 1,1 a 2,0 da SEQ ID NO: 13).
The analysis of the deduced amino acid sequence (aa) of the C-terminal region showed similarity levels between 67 and 1,0% within the groups, while the analysis of the D region (C-terminal subunit) resulted in levels of similarity between 60 and 1,0%.
A análise da sequencia de aminoácidos (aa) deduzidos da região C-terminal mostrou níveis de similaridade entre 67 e 1,0% dentro dos grupos, enquanto a análise da região D (subunidade C-terminal) resultou níveis de similaridade entre 60 e 1,0%.
Thus, the sequence contig3/contigA hybrid has two cysteine residues in addition to revealing differences in amino acid C - terminal region when aligned with other legume lectins.
Sendo assim, a sequência híbrida contig3/contigA possui 2 resíduos de cisteína além de revelar diferenças de aminoácidos na região C-terminal quando alinhada com outras lectinas de leguminosas.
The prediction of the structure of the NSs protein revealed the presence of a sequence of thirteen amino acids in the C-terminal region of the protein, which has similarity as a TNF receptor, and this could shed light into a possible mechanism of apoptosis to be validated by experiments silencing target genes in Hela cells.
A predição da estrutura da proteína NSs revelou a presença de uma sequência de treze aminoácidos na região C-terminal da proteína, que tem similaridade como receptor de TNF. Ensaio de PCR array indicou que a proteína NSs de OROV causa aumento na quantidade de transcritos de TNF em células HeLa.
In addition, it was possible to evidence an expressive correlation between the C-terminal tripeptide sequence and the high biological activity evaluated.
Além disso, foi possível evidenciar uma expressiva correlação entre a sequência tripeptídica da região C-terminal com a alta atividade biológica avaliada.
a basic N-terminal region, a central hydrophobic region, and a more polar C-terminal region.
Uma região N-terminal básica, uma região hidrófoba central, e uma região C-terminal polar.
In one embodiment, Y can be an amino acid sequence including at least a portion of the C-terminal amino acid residues of the human IgG1 hinge region (amino acid residues 99,113 of SEQ ID NO: 11), p can be 1 or 0, Z2 can be an amino acid sequence including at least a portion of the N-terminal region of the human IgG2 CH2 (amino acid residues at positions 111,147 of SEQ ID NO: 12), and Z3 can be an amino acid sequence including at least a portion of the C-terminal region of any of the human IgG subclasses (amino acid residues at positions 118,223 of SEQ ID NO:11, 114,219 of SEQ ID NO:12, 165,270 of SEQ ID NO: 24, or 1,5 to 2,0 of SEQ ID NO: 13).
Em uma concretização, Y pode ser uma sequência de aminoácidos incluindo pelo menos uma parte dos resíduos de aminoácidos C-terminal da região de dobradiça da IgG1 humana (resíduos de aminoácidos 99 a 1,3 da SEQ ID NO: 11), p pode ser 1 ou 0, Z2 pode ser uma sequência de aminoácidos incluindo pelo menos uma parte da região N-terminal do CH2 da IgG2 humana (resíduos de aminoácidos nas posições 1,1 a 1,7 da SEQ ID NO: 12), e Z3 pode ser uma sequência de aminoácidos incluindo pelo menos uma parte da região C-terminal de qualquer uma das subclasses da IgG humana (resíduos de aminoácidos nas posições 1,8 a 2,3 da SEQ ID NO:11, 1,4 a 2,9 da SEQ ID NO:12, 1,5 a 2,0 da SEQ ID NO: 24, ou 1,5 a 2,0 da SEQ ID NO: 13).
In another embodiment, Y can be an amino acid sequence including at least a portion of the C-terminal region of the human IgD hinge region (amino acid residues at positions 99 to 1,2 of SEQ ID NO: 14), p can be 1 or 0 (zero), Z2 can be an amino acid sequence including at least a portion of the N-terminal region of the human IgD CH2 domain (amino acid residues at positions 1,3 to 1,9 of SEQ ID NO: 14), and Z3 can be an amino acid sequence including at least a portion of the C-terminal region of the human IgG4 CH2 domain (amino acid residues at positions 1,1 to 2,0 of SEQ ID NO: 13).
Em outra concretização, Y pode ser uma sequência de aminoácidos incluindo pelo menos uma parte da região C-terminal da região de dobradiça da IgD humana (resíduos de aminoácidos nas posições 90 a 1,2 da SEQ ID NO: 14), p pode ser 1 ou 0 (zero), Z2 pode ser uma sequência de aminoácidos incluindo pelo menos uma parte da região N-terminal do domínio CH2 da IgD humana (resíduos de aminoácidos nas posições 1,3 a 1,9 da SEQ ID NO: 14), e Z3 pode ser uma sequência de aminoácidos incluindo pelo menos uma parte da região C-terminal do domínio CH2 da IgG4 humana (resíduos de aminoácidos nas posições 1,1 a 2,0 da SEQ ID NO: 13).
a basic N-terminal region, a central hydrophobic region, and a more polar C-terminal region.
Uma região N-terminal básica, uma região hidrófoba central, e uma região C-terminal polar.
...This protein inhibits DNA gyrase (gyrase) through a bipartite mechanism where the zinc-finger domain prevents the DNA ligation to the B subunit (GyrB) and the C-terminal bindings to the A subunit (GyrA). Although it is classified as a gyrase inhibitor neither the inhibition activity of YacG from E. coli and other microorganisms against other DNA topoisomerases nor the biological activity of fragments in cell...
...olismo do stress em procariotos. YacG atua na inibição da atividade de DNA girase por um mecanismo bipartido, a região do domínio zinc-finger atua impedindo a ligação do DNA à subunidade B e a região C-terminal liga-se a subunidade A. Embora a literatura cite YacG como sendo um inibidor de DNA girase, nada foi observado a respeito da atividade de inibição de YacG de E.coli e de outras linhagens de micro-organismos frente a outras DNA topoisomerases e não foi realizado nenhum trabalho envolvendo ...
...PXL/l protein-protein recognition motifs, which interact with PalA, were localized in the C-terminal region of PacCCp between amino acid residues 6,7 and 7,2. pacC and palA identification suggests that C. perniciosa presents a signaling cascade in response to pH, which would allow PacCCp transcription factor to act as a regulator of environmental pH controlled virulence factors...
...inoácidos, com domínios dedos de zinco extremamente conservados em leveduras e fungos
filamentosos. Motivos de reconhecimento proteína-proteína YPXL/I de interação com PalA foram localizados na região C-terminal da proteína PacCCp entre os aminoácidos 6,7 e 7,2. A identificação dos genes pacC e palA sugere que C.
perniciosa, apresenta a cascata de sinalização em resposta ao pH....
...s substrate for glycogen synthase elongation. These proteins were also able to recover the glycogen deficiency phenotype in a S. cerevisae mutant strain. Moreover, the gnn gene expression was shown to be ...(Complete abstract, click electronic access below)...
...os sítios de glicosilação, os quais contribuem diferencialmente para este processo. Análise das interações entre GNN e a proteína glicogênio sintase de N. crassa (GSN) demonstrou que a região C-terminal da GNN é a mais importante para a interação. Entretanto, o......
... transcripts, exon 14 skipping followed by selection of the exon 15 third splicing acceptor site, shifts the open reading frame of the downstream codons creating a putative FMRP isoform with a novel C-terminus, which lacks the nuclear localization signal and the major RNA binding domain, RGG box. The relevance of such isoform is as yet unknown. In the present study, we assessed, by RT-qPCR, the expression of rat Fm...
...ritos do FMR1, associada ao uso do terceiro sítio de splicing do éxon 15 do FMR1, acarreta mudança da fase de leitura dos códons subsequentes, produzindo potencialmente isoformas da FMRP com nova região C-terminal. sem o sinal de localização nuclear e o domínio RGG, principal efetor de sua associação a RNAs. Sua importância funcional ainda não foi estudada. neste módulo, avaliamos por RT-qPCR a expressão dos transcritos que incluem e excluem o éxon 14 do Fmr1 no SNC de ratos e identificamos o córt...
...ve in the auto repression of the parDE operon. The toxin (12 kDa) exhibits cytotoxic activity by blocking DNA replication, acting directly in the DNA gyrase action. Previous studies have been suggest that the C-terminal region of the antitoxin is responsible for the interaction process with ParE. Although this toxin can be find in a large number of microorganisms, still have cytotoxicity mechanisms and cellu...
...essão do operon parDE. A toxina (12kDa) apresenta atividade citotóxica no processo de replicação do DNA por interferir diretamente na ação da DNA girase. Estudos prévios sugeriram que a região C-terminal da antitoxina é responsável pelo processo de interação com ParE. Embora esta toxina possa ser encontrada em um grande número de microrganismos, ainda apresenta mecanismos de citotoxicidade e funções celulares a serem elucidadas. Neste contexto, este trabalho teve como objetivo a tenta...
...n between Pub1 and Nab2 was confirmed by co-purification and in vitro binding assays. The interaction is mediated by the Nab2 zinc finger domain. Analysis of the functional link between these proteins reveals that Nab2, like Pub1, can modulate the stability of specific target mRNA transcripts. We find that the half-life of the RPS16B transcript, an ARE-likecontaining Pub1 target, is decreased in both nab2,1 and nab...
...interação entre Pub1 e Nab2 foi confirmada por co-purificação e ensaio de interação in vitro. Foi demonstrado também que essa interação é mediada pelo domínio de dedos de zinco presente na região C-terminal de Nab2. A análise da relação funcional entre essas duas proteínas revelou que Nab2, assim como Pub1, é capaz de modular a estabilidade de mRNA. A estabilidade do transcrito de RPS16B, mensageiro contendo sequência ARE-like e regulado por Pub1, é diminuída nos mutantes nab2- 1 e nab2...
...tein GST-Cx26, and absent in the GST assay, were performed by mass spectrometry. We identified a total of 49 candidate proteins for interaction with the C-terminal region of Cx26. In silico analyses performed in several databases and search in the literature allowed exclusion of candidates by: (i) redundancy of representation in the GST-Cx26 experiments; (ii) discrepancy between the expected and the obtained molecu...
...precipitação com a proteína de fusão GST-Cx26 e ausentes no ensaio com a GST, foram realizadas por espectrometria de massas. Identificamos um total de 49 proteínas candidatas a interagirem com a região C-terminal da Cx26. Realizamos diversas análises in silico e em literatura específica e após exclusão de candidatas por: (i) redundância de representação no ensaio GST-Cx26, (ii) diferença entre a massa molecular esperada e a obtida, (iii) precipitação inespecífica e (iv) localização subcelular i...
...module it is described the obtaining of a several peptides mimics, rationally design, based on the primary structure of natural CcdB toxin, to a better understanding the inhibition mechanism of the activity of the gyrase and topo IV, by CcdB toxin, and also propose a new molecules group with potential antibacterial activity. The peptides mimics were synthesized by Solid Phase methodology (SPPS), purified and analyz...
...B atua como uma toxina e o CcdA como a antitoxina. Na ausência de CcdA, CcdB pode matar a bactéria através de um mecanismo, ainda pouco conhecido, que envolve a girase e/ou a topo IV, assim como a região C-terminal da toxina CcdB (Trp-99 a Ile-1,1). neste módulo está descrita a obtenção de uma série de seqüências peptídicas miméticas, racionalmente projetadas, baseadas na estrutura primária do CcdB natural, com o objetivo de melhor entender o mecanismo de inibição da atividade de ambas, DNA girase...
...alytic activity. However, these proteins can perform myonecrosis by a Ca2+-independent mechanism probably, due to action of C-termini region residues. in this module, by x-ray crystallography studies with bothropic Lys49-PLA2s in native and chemically modified by p-bromophenacyl bromide (BPB) forms, we revised the position of Lys1,2, previously pointed as one of the responsibles of Lys49-PLA2s due to hiperpolarizat...
...o 49 de um resíduo de Asp para um resíduo de Lys, não apresenta atividade catalítica, mas é capaz de induzir mionecrose por um mecanismo Ca2+ independente devido, provavelmente, à resíduos da região C-terminal. neste módulo, através de estudos por cristalografia de raios-X de Lys49-PLA2s botrópicas nativas e quimicamente modificadas pelo brometo de p-bromofenacila (BPB), revisamos a posição da Lys1,2 – anteriormente apontado como um dos responsáveis ela ausência da atividade catalítica das Lys4...
...tor (SR1) and the partial sequence of aminoacids of the salicylic acid binding protein (SABP), both in Nicotinana tabacum, showed 82% and 77% of identities, respectively, when compared with Cat-C. In the C-terminal region of this catalase was detected the presence of a peroxisomal sequence. However, instead of a SRL sequence (Serine-Arginine-Leucine), a TRL sequence was found (Treonine- Arginine-Leucine). Th...
...arcial de aminoácidos da proteína de ligação ao ácido salicílico (SABP), ambos de N. tabacum, apresentaram 82% e 77% de identidade, respectivamente, quando comparadas a Cat- C. Na região C-terminal desta catalase foi detectada a presença de uma seqüência peroxissomal. No entanto, ao invés de uma seqüência SRL (Serina-Arginina- Leucina), foi encontrada uma seqüência TRL (Treonina-Arginina-Leucina). Esta diferença é devido à troca de uma timina por uma adenina. Estes dados sugerem qu...
...ghlight the C-terminal region and structural studies points to a myotoxic site, composed by basic residues, and a hydrophobic knuckle, composed by aromatic and hydrophobic, in the C-terminal region. The present study aims to gather more knowledge about this myotoxic calcium independent mechanism of action. For this purpose, the botropic myotoxins BthTX-II (an Asp49- PLA2), BthTX-I and PrTX-I (homologue PLA2s) were ...
...o do C-terminal e estudos cristalográficos propõem, mais especificamente, um sítio miotóxico composto por resíduos básicos e um hydrophobic knuckle composto por hidrofóbicos, ambos situados na região C-terminal da toxina. O presente trabalho tem objetivo de oferecer mais detalhes acerca do mecanismo de ação miotóxico independente de cálcio. Para tanto, realizamos estudos cristalográficos com miotoxinas botrópicas BthTX-II (uma Asp- PLA2s), BthTX-I e PrTX-I (duas PLA2s homólogas), em presença de í...
...owed that this protein has an apparent molecular mass of 12,85 kDa and it is unstable in cytoplasmic conditions. It has derived signal sequences, one for the signal peptide with 30 amino acids, and a sequence at the C-terminus of this protein, related to the anchorage to the plasma membrane as well as the endoplasmic reticulum. Moreover, probable sites of O-glycosylation and phosphorylation were identified. One dom...
...aparente em torno de 12,85 kDa e, em condições citoplasmáticas apresenta-se instável. Possui sequências sinais deduzidas, sendo uma para peptídeo sinal, com 30 aminoácidos, e uma sequência na região C-terminal relacionada à ancoragem desta proteína à membrana plasmática, bem como ao retículo endoplasmático. Ademais, prováveis sítios de O-glicosilação e de fosforilação foram identificados. Um domínio relacionado às funções de transferência de lipídeos, de reserva e de inibidores de trips...
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