An open reading frame (ORF) is a portion of a gene's sequence that contains a sequence of bases, uninterrupted by stop sequences, that could potentially encode a protein. (http://www.physicsforum...)
Exemplos de tradução
In one assay format, cell lines that contain reporter gene fusions between nucleotides from within the open reading frame defined by nucleotides 53,643 of SEQ ID NO: 1 and/or the 5' and/or 3' regulatory elements and any assayable fusion partner may be prepared.
Em um formato de ensaio, podem-se preparar linhagens celulares que contêm fusões do gene repórter entre os nucleotídeos de dentro do quadro de leitura aberto definido pelos nucleotídeos 53,643 da SEQ ID NO: 1 e/ou os elementos reguladores 5’ e/ou 3’ e qualquer parceiro de fusão ensaiável.
Banco de Glossários (traduções não verificadas)
Área
Inglês
Português
Qualidade
Téc/Geral
open reading frame
quadro aberto de leitura
Téc/Geral
open reading frame
fase ou quadro aberto de leitura
Téc/Geral
open reading frame
enquadramento de leitura aberto
Téc/Geral
Long open reading frame
região de leitura aberta distante
Téc/Geral
long open reading frame
região de leitura aberta distante
Téc/Geral
open reading frame (ORF)
região de abertura de leitura
Frases traduzidas contendo "open reading frame"
In one assay format, cell lines that contain reporter gene fusions between nucleotides from within the open reading frame defined by nucleotides 53,643 of SEQ ID NO: 1 and/or the 5' and/or 3' regulatory elements and any assayable fusion partner may be prepared.
Em um formato de ensaio, podem-se preparar linhagens celulares que contêm fusões do gene repórter entre os nucleotídeos de dentro do quadro de leitura aberto definido pelos nucleotídeos 53,643 da SEQ ID NO: 1 e/ou os elementos reguladores 5’ e/ou 3’ e qualquer parceiro de fusão ensaiável.
Transgenic animals containing mutant, knock-out or modified genes corresponding to the cDNA sequence of SEQ ID NO: 1, or the open reading frame encoding the polypeptide sequence of SEQ ID NO: 2, or fragments thereof having a consecutive sequence of at least about 3, 4, 5, 6, 10, 15, 20, 25, 30, 35 or more amino acid residues, are also included in the invention.
Animais transgênicos contendo genes mutantes, “nocaute” ou modificados correspondente à seqüência DNAc da SEQ ID NO: 1, ou o quadro de leitura aberto codificando a seqüência de polipeptídios da SEQ ID NO: 2, ou fragmentos destas tendo uma seqüência consecutiva de pelo menos cerca de 3, 4, 5, 6, 10, 15, 20, 25, 30, 35 ou mais resíduos de aminoácidos, também são incluídos na invenção.
Even more preferred hybridizing molecules are those that hybridize under the above conditions to the complement strand of the open reading frame of SEQ ID NO: 1.
Moléculas de hibridização ainda mais preferidas são aquelas que se hibridizam sob as condições acima para o filamento de complemento do quadro de leitura aberto da SEQ ID NO: 1.
The mfs1 gene can be organized in a cluster in view that a second open reading frame. which corresponds to a transcription factor superfamily containing a Zn2-Cys6 domain, identified as clft1, was observed in 3` downstream region of this gene.
O gene mfs1 pode estar organizado em um conjunto de genes com funções relacionadas, uma vez que downstream à região 3R,7; deste foi identificada uma segunda janela aberta de leitura correspondente a uma proteína da superfamília de fatores de transcrição contendo o domínio Zn2-Cys6, identificado como clft1.
Chi_I5,5 analysis indicated an open reading frame of 20,5 base pairs encoding a protein of 6,4 amino acids and a molecular weight of 74,24 kDa.
A análise de chi_I5,5 indicou uma fase de leitura aberta de 20,5 pares de bases que codificam uma proteína com 6,4 aminoácidos e peso molecular de 74,24 kDa.
The open reading frame (ORF), which are regions with potential to encode a protein were predicted using the resulting assembly.
As open reading frame (ORFs), que são regiões com potencial para codificar proteínas, foram preditas utilizando as sequências resultantes da montagem.
An open reading frame within the cDNA nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1, at nucleotides 53,640 (53,643 including the stop codon), encodes a protein of 1,6 amino acids.
Um quadro de leitura aberto dentro da seqüência de nucleotídeos de DNAc da SEQ ID NO: 1, nos nucleotídeos 53,640 (53,643 incluindo o códon de parada), codifica uma proteína de 1,6 aminoácidos.
The nucleic acid molecule is then preferably placed in operable linkage with suitable control sequences, as described above, to form an expression unit containing the protein open reading frame.
A molécula de ácido nucléico é então colocada preferencialmente em ligação operável com seqüências de controle adequadas, como descrito acima, para formar uma unidade de expressão contendo o quadro de leitura aberto da proteína.
The genome has 2,700 nucleotides and a single open reading frame sequence (ORF) encoding a RNA-dependent RNA polymerase with conserved domains of the superfamily of RdRps mitovirus, a group of viruses that replicate in mitochondria of host cells.
O genoma possui 2,700 nucleotídeos e apresenta uma única sequência aberta de leitura (ORF) que codifica uma RNA polimerase dependente de RNA, com domínios conservados na superfamília de RdRps de mitovirus, um grupo de vírus que replica em mitocôndrias das células hospedeiras.
This polymorphic molecular marker amplified a region of DNA that corresponds to a partial open reading frame of C. arabica genome that encodes a disease resistance protein.
Esse marcador molecular polimórfico amplificou uma região do DNA que corresponde a uma janela aberta de leitura parcial do genoma de C. arabica que codifica uma proteína de resistência a doenças.
The plg1 gene has an open reading frame of 13,1 bp coding for a putative protein of 3,4 amino acids with a calculated molecular mass of 40,1 kDa.
Le gene plg1 a un cadre de lecture ouvert de 13,1 paires de base codant une proteine putative de 3,4 acides amines ayant un masse moleculaire calcule de 40,1 kDa.
The sequences obtained for the NSP2, NSP3, and VP6 coding genes covered the complete open reading frame (ORF), while the partial ORF was determined for the VP1, VP2, VP3, VP4, VP7, NSP1, NSP4, NSP5 and NSP6 coding genes.
As sequências obtidas para os genes codificadores das proteínas NSP2, NSP3 e VP6 contemplaram a open reading frame (ORF) completa do gene, enquanto que a ORF parcial foi determinada para os genes codificadores das proteínas VP1, VP2, VP3, VP4, VP7, NSP1, NSP4, NSP5 e NSP6.
The dengue viruses have single-stranded, positive polarity RNA genome that encodes proteins in a long open-reading frame (ORF).
Os dengue vírus são vírus de genoma RNA fita simples polaridade
positiva que codifica as proteínas em uma longa open reading frame .
...The genomic data mining analysis of a Mesorhizobium sp. revealed the presence of a 12,7-bp open reading frame containing the Mesoamp gene, which encodes a protein of 4,8 amino acids. The deduced amino acid sequence was 50% identical to the thermostable amino-peptidase from Thermus thermophilus, a member of peptidase family M29, and eight fingerprints signatures for a thermophilic metalloprotease were found. The mes...
...A análise de mineração de dados genômicos de Mesorhizobium sp. revelou a presença de uma ORF de 12,7pb contendo o gene mesoamp, que codifica uma proteína de 4,8 aminoácidos. A sequência de aminoácidos deduzida apresenta 50% de identidade com uma amino-peptidase termoestável de Thermus thermophilus, membro da família de peptidase M29, e oito assinaturas caraterísticas das metalo-protease termofílicas foram encontrados. O gene mesoamp foi clonado e expresso em Escherichia coli. A massa molecular da pro...
...t of a non-cytophatic Brazilian BVDV strain IBSP4-ncp. The cDNA recombinant clone was constructed by yeast homologous recombination with a low-copy vector, from three genomic fragments comprising the open reading frame (ORF). The two untranslated regions (5' and 3' UTR) were replaced by the respective UTRs of the reference strain NADL. The constructed vector was transcribed in vitro and the resulting RNA was...
...binante foi construído pela técnica de recombinação homóloga em levedura, utilizando um vetor de baixo número de cópias, construído a partir de três fragmentos genômicos, que compreendiam a fase aberta de leitura (open reading frame, ORF) do vírus. As duas regiões não traduzidas (5 e 3 UTR) foram substituídas pelas respectivas UTRs da cepa de referência NADL. O vetor construído foi transcrito in vitro e o RNA obtido foi transfectado em células MDBK para recuperação de vírus infecciosos....
...otypes without cross-reactivity (A, O, C, Asia 1, SAT-1, SAT-2 and SAT-3) and many variants within each serotype. The viral particle shape is icosahedral, and the viral genome is composed of a single open reading frame. organised in two principal regions: the structural proteins (SPs) and non-structural proteins (NSPs). The SPs are the proteins that will form the entire capsid shell structure. The NSPs are proteins...
...e variável e consiste em sete sorotipos sem imunidade cruzada entre si (A, O, C, Asia 1, SAT-1, SAT-2 e SAT-3) com muitas variedades dentro de cada sorotipo. Sua partícula viral tem formato icosaédrico e o genoma viral é composto por uma única fase aberta de leitura, organizada em duas regiões: proteínas estruturais (PEs) e proteínas não estruturais (PNEs). Devido à grande variedade de sorotipos, os estudos filogeográficos são imprescindíveis para uma melhor compreensão da movimentação e evoluçã...
...t in the sequencing project database and from one recombinant phage. CpSaci1 contains 6,856 bp and long direct terminal repeats (LTRs) of 4,3 bp that do not present regions usually found in LTRs. Two open reading frame (ORFs) were identified and they code proteins with similarity to GAG and to a POL polyprotein showing protease, reverse transcriptase, RNase H, and integrase domains. Partially characterized DNA sequ...
...agos recombinantes obtidos. CpSaci1 possui 6,856 pares de bases (pb) e contém longas repetições terminais (LTRs) diretas de 4,3 pb que não apresentam regiões normalmente encontradas em LTRs de retrotransposons. Duas seqüências de leitura aberta (ORFs) foramidentificadas codificando peptídeos similares à GAG e à poliproteína POL contendo os domínios protease, transcriptase reversa, RNase H e integrase. A seqüência de DNA de CpSaci2, que foi parcialmente caracterizada, possui cerca de 82% de identidad...
... mechanisms underlying the responses of T. rubrum to stress conditions and may aid the development of new antifungal drugs. Furthermore, these results contribute to improve gene annotation and open reading frame prediction for T. rubrum and other dermatophyte genomes and transcriptomes....
...lise em larga escala contribuem com a elucidação dos mecanismos moleculares envolvidos na adaptação ao estresse em dermatófitos e podem auxiliar o desenvolvimento de novas drogas antifúngicas. Além disso, estes resultados contribuem com a anotação do genoma e transcritoma de T. rubrum e outros dermatófitos....
...n this module, we established a computational approach, with steps to exclude low quality and paralogous regions, aiming to identify genetic variants in expressed sequences generated by the method of open reading frame ESTs (ORESTES) for the Human Cancer Genome Project. Unlike other polymorphisms detection softwares, the computational approach described in this module takes into account the a priori information abo...
...polimorfismos do NCBI. No presente estudo, foi estabelecida uma abordagem computacional, com etapas de exclusão de regiões parálogas ou de baixa qualidade, com o objetivo de identificar variantes genéticas em sequências expressas gerados pelo método de Open Reading Frame ESTs (ORESTES) durante o Projeto Genoma Humano do Câncer. Diferentemente de outros softwares de detecção de polimorfismos, a abordagem computacional descrita neste estudo leva em consideração a informação a priori do número d...
...tion regulator with important roles in synaptic maturation and elimination. In primary FMR1 transcripts, exon 14 skipping followed by selection of the exon 15 third splicing acceptor site, shifts the open reading frame of the downstream codons creating a putative FMRP isoform with a novel C-terminus, which lacks the nuclear localization signal and the major RNA binding domain, RGG box. The relevance of such isoform...
...onal atuando na maturação e eliminação sináptica. A exclusão do éxon 14 de transcritos do FMR1, associada ao uso do terceiro sítio de splicing do éxon 15 do FMR1, acarreta mudança da fase de leitura dos códons subsequentes, produzindo potencialmente isoformas da FMRP com nova região C-terminal, sem o sinal de localização nuclear e o domínio RGG, principal efetor de sua associação a RNAs. Sua importância funcional ainda não foi estudada. neste módulo, avaliamos por RT-qPCR a expressão dos tran...
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