Diagrama que representa a ordem linear e a posição dos genes pertencentes ao mesmo grupo de ligação.
Meaning
A genetic map assembled from recombination data that shows the order of mutant sites and genes along a nucleic acid molecule. (http://www.sci.sdsu.edu...)
Exemplos de tradução
The linkage map for this population was constructed after genotyping the 6,4 animals for 35 microsatellite markers.
O mapa de ligação para essa população foi construído após a genotipagem de 6,4 animais para 35 marcadores microssatélites.
Exemplos de tradução
The linkage map for this population was constructed after genotyping the 6,4 animals for 35 microsatellite markers.
O mapa de ligação para essa população foi construído após a genotipagem de 6,4 animais para 35 marcadores microssatélites.
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Qualidade
Biotecnologia
Linkage map
mapa de ligação
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The linkage map for this population was constructed after genotyping the 6,4 animals for 35 microsatellite markers.
O mapa de ligação para essa população foi construído após a genotipagem de 6,4 animais para 35 marcadores microssatélites.
In addition, the localization of 58 rDNA genes is not yet available in the linkage map or in the sequenced genome of Eucalyptus.
Além disso, a localização dos genes de rDNA 58 ainda não se encontra disponível no mapa de ligação ou no genoma sequenciado de Eucalyptus.
...Linkage analysis was initially performed by genotyping of all families with chip-based methods that assayed 60,6 sNP markers. Subsequent refinement of linkage locations used polymorphic microsatellite markers analyzed by capillary electrophoresis unsing an automated DNA sequencer. Unrelated normal Brazilian samples were used as a control group to estimate the allele frequencies of these markers in this population....
...igação, inicialmente foi realizada a genotipagem de todas as famílias através de chips específicos para essa finalidade contendo 60,6 marcadores SNP. Posteriormente, para o refinamento do mapa de ligação foram utilizados marcadores microssatélites polimórficos marcados com fluoróforos e analisados em sequenciador automático capilar. Para as estimativas das frequências alélicas destes marcadores na população brasileira foram utilizados amostras do grupo controle, não relacionadas, previamen...
...ts in a F2 pig population developed by mating two Brazilian Piau sires with 18 crossbred dams (Landrace x Large White x Pietrain). The linkage map for this population was constructed after genotyping the animals for 11 microsatellite markers and scoring the genotype. Estimates of polymorphic information content (PIC) indicated that the microsatellite markers were appropriate for QTL analyses. Data were analyzed by...
...o de dois varrões da raça naturalizada brasileira Piau com 18 fêmeas de linhagem comercial (Landrace x Large White x Pietrain). A população foi genotipada para 11 marcadores microssatélites e o mapa de ligação específico dos marcadores para a população foi construído. Os marcadores de microssatélites foram considerados adequados para estudos de características quantitativas quando analisado o conteúdo de informação polimórfica (PIC). Para identificação do QTL, utilizou-se o método de regress...
...ted SCAR primers were tested together with 45 pairs of commercial SSR primers between the genitors of 1,4 RIL populations. From the selected primers, 7 were mapped into 10 groups of a partial linkage map already available in the lab, whereas one stayed discoupled. The linkage map was slightly altered in its size (247,8/2,2 cM) and number of linkage groups (9,10 groups). Variance analysis detected siginificative as...
...e comerciais, entre os genitores de uma população de 1,4 RIL ́s. Dos primers selecionados, 7 foram mapeados em 10 grupos de um mapa parcial de ligação já existente e 1 permaneceu não-ligado. O mapa de ligação sofreu pequena variação no tamanho (247,8/2,2 cM) e no número de grupos de ligação (9,10 grupos). Entretanto, pela análise de variância foram constatadas associações significativas desses marcadores com diferentes características quantitativas. As associações mais significativas foram c...
...the matting of two Brazilian naturalized Piau boars with 18 commercial females (Landrace × Large White × Pietrain). The population was genotyped for 14 microsatellite markers covering chromosomes 5, 7 and 8. After that, it was built the linkage map for each chromosome. Analysis of association were done using interval mapping by regression for QTL detection. For carcass and cuts of carcass traits, 20 QTL were map...
...ra Piau e 18 fêmeas comerciais (Landrace × Large White × Pietrain). A população foi genotipada para 14 marcadores microssatélites cobrindo os cromossomos 5, 7 e 8. Em seguida, foi construído o mapa de ligação para cada cromossomo. As análises de associação foram feitas usando o mapeamento de intervalo por regressão para detecção de QTL. Para características de carcaça e cortes de carcaça, foram mapeados 20 QTL nos três cromossomos, enquanto, para características de qualidade de carne, ...
...; 0,66 and 0,61; in the chromosome 7, the values found were 0,81, 0,1 and 0,67 and in the chromosome 8 had the average values for Ho, He and PIC of 0,65; 0,65 and 0,61 respectively. After the genotype scoring, it was constructed the linkage map for these markers in the population. Association analyses were performed using interval mapping by regression for QTL detection. Seventeen QTL were mapped for carcass and c...
...ontrados foram 0,73; 0,66 e 0,61; no cromossomo 7, os valores encontrados foram 0,81, 0,1 e 0,67 e no cromossomo 8 os valores foram 0,65; 0,65 e 0,61. Com o resultado da genotipagem foi construído o mapa de ligação específico dos marcadores para a população desenvolvida. As análises de associação foram feitas utilizando mapeamento por intervalo por regressão para detecção de QTL. Foram detectados 17 QTL para características de carcaça e corte de carcaça nos três cromossomos, enquanto para ...
...markers saggcat.1,8 - sAV14,940 and sAV18,590 - sZ04,500. Markers identified by multiple regression analysis were also detected by interval mapping, except for the marker iAB09,464 that were not linked on the genetic map performed in this module....
...18,590 - sZ04,500. Os marcadores identificados pela análise de regressão múltipla também o foram pelo mapeamento por intervalo, com exceção do marcador iAB09,464, que não se encontra ligado no mapa de ligação construído no presente trabalho....
...racterization of genetic resources stored in this collections. In the QTL and mapping studies, presented in Chapter 2, the SSR markers were used to construct the genetic linkage map and identification of genetic factors associated with resistance to coffee leaf rust (Hemileia vaxtatrix), which is the major foliar disease coffee. in this module, we used a population of full-sib progenies, that is maintained in the ...
...rização dos recursos genéticos armazenados nas coleções. Para os estudos de mapeamento e análises de QTLs, apresentados no capítulo 2, os marcadores SSR foram utilizados para a construção do mapa de ligação genético e identificação de fatores genéticos associados à resistência à ferrugem (Hemileia vaxtatrix), que atualmente é a principal doença foliar do cafeeiro. Neste estudo, progênies de irmãos completos de uma população de melhoramento do Incaper (Instituto Capixaba de Pesquisa, Assis...
...eeds resistant to several diseases and to varieties with black seeds, resistant to diseases, productive and with non-prostrate growth habit (type IIb). Based on 14 disease resistance loci, seven morphological traits, and 49 molecular markers a genetic linkage map was built and eight quantitative trait loci related with cycle and yield were mapped. Using a LOD score of 4,0 and a recombination frequency of 0,40, 43 ...
...o prostado (IIb). Com base em 14 características de resistência a doenças, sete características morfológicas, 49 marcadores moleculares e oito características quantitativas, foi construído um mapa de ligação gênica e mapeado os locos de características quantitativas relacionadas ao ciclo e ao rendimento do feijoeiro-comum. Adotando um valor de LOD de 4,0 e uma freqüência máxima de recombinação de 0,40, 43 marcadores, que segregaram na proporção esperada (1,1) a P<0,05 foram mapeados em nove gr...
...The present work aimed at increasing the number of markers in the soybean linkage map built by the Bioagro/UFV breeding program for soybean quality. It also aimed at identifying QTLs (Quantitative Trait Loci) governing protein accumulation in the seed. RAPD molecular markers and microsatellites which had not been mapped before were added to the original map. One hundred and eighteen recombinant inbred lines (RILs)...
...O presente trabalho teve como objetivo o aumento do número de marcas no mapa de ligação da soja construído pelo programa de melhoramento da qualidade da soja do Bioagro/UFV e também a identificação de QTLs (Quantitative Trait Loci) associados à determinação do conteúdo de proteínas em sementes de soja. Para isso, foram acrescentados ao mapa original, marcadores do tipo RAPD e marcadores microssatélites não mapeados anteriormente. Foram utilizadas 1,8 linhagens recombinantes endogâmicas (RILs) obti...
...se maps were constructed with the goal to characterize and identify possible QTLs candidates associated with these characteristics. Fifty RAPD markers were added to the parcial map of population 3, RC 1 . A total of 1,7 RAPD markers were obtained with 1,4 (90,51%) of them showing segregation 1,1 (P < 0,01) and 13 (9,49%) with segregation 2,1. In order to construct the map, 1,4 markers that segregated 1,1, with 26 ...
...de que eles não estejam ligados) de 3,0 e r (freqüência máxima de recombinação entre o QTL e o marcador) de 0,40. Para a população 3, RC 1 um dos objetivos foi aumentar o número de marcas no mapa de ligação do cafeeiro, construído pelo programa de melhoramento do cafeeiro da Universidade Federal de Viçosa (UFV)/Empresa de Pesquisa Agropecuária de Minas Gerais (EPAMIG). Tais mapas foram construídos, visando caracterizar e identificar os possíveis QTLs candidatos associados a essas características...
...mmercial dams (Landrace x Large White x Pietrain). The population was genotyped for 11 microsatellite markers. After the genotype scoring, it was constructed the linkage map for these markers in the population. The microsatellites markers were considered appropriate for quantitative trait analysis. It was analyzed their values for observed heterogosity (Ho), expected heterozigosity (He) and polymorphic information...
...meas da linha comercial (Landrace x Large White x Pietrain). Foram utilizados onze marcadores microssatélites distribuídos nos SSC16, SSC17 e SSC18. Com o resultado da genotipagem foi construído o mapa de ligação específico dos marcadores para a população desenvolvida. Os marcadores de microssatélites foram considerados adequados para estudos de características quantitativas, quando foram analisadios os valores de heterozigosidade observada (Ho), heterozigosidade esperada (He) e conteúdo de informaç...
...The objective of this study was to construct a linkage map and identify markers associated with yield components (diameter, weight, height, stalk number and productivity) and quality parameters (Brix, Fiber and Pol%Cana), in a progeny derived from a cross of the elite clone IACSP95,3018 and the variety IACSP93,3046, both developed from the IAC Sugarcane Breeding Program. We used molecular markers AFLP and genomic ...
...O objetivo deste trabalho foi construir um mapa de ligação e identificar marcadores associados aos componentes de produção (diâmetro, peso, altura, número de perfilhos e TCH) e parâmetros de qualidade (Fibra, Brix e Pol%Cana), em uma progênie derivada cruzamento entre o clone IACSP95,3018 e a cultivar IACSP93,3046, desenvolvidas pelo Programa de Melhoramento Cana IAC. Para tanto, foram utilizados marcadores moleculares do tipo AFLP e microssatélites genômicos e derivados de ESTs. A progênie mos...
...imals. The population was genotyped for 16 microsatellite loci covering the chromosomes 1, 2 and 1,4. Based on the genotypes a specific linkage map was constructed for this population. Association analyses were performed using interval mapping by regression for QTL detection. A decision tree for identifying QTL with parent-of-origin effects based on tests against the Mendelian mode of expression was used. Twenty t...
...a e qualidade de carne. Para a genotipagem de todos os animais, foram utilizados 16 locos de microssatélites distribuídos nos cromossomos 1, 2 e 4. Com o resultado da genotipagem, foi construído o mapa de ligação específico dos marcadores para a população desenvolvida. As análises de associação foram baseadas no mapeamento por intervalo usando métodos de regressão. Para identificar QTL com efeito da origem parental dos alelos, foi utilizada uma árvore de decisão baseada em testes contra o modelo d...
...body weight at 35 and 41 days of age, heart and lungs weights and heart and lungs yields. Genotypes of six microsatellite markers were added to those of ten previously used. The linkage map of this region spanned 110,8 cM, with average spacing of 7,4 cM between markers. In a single interval (LEI01,6-LEI01,4), comprising 28,8 cM, QTLs for all traits, except for heart and lungs yields were mapped in the F2 analysis....
...aos 35 e 41 dias de idade, pesos do coração e pulmões e rendimentos de coração e pulmões. Os genótipos de seis marcadores microssatélites foram adicionados aos dez utilizados anteriormente. O mapa de ligação obtido da região compreendeu 110,8 cM com espaçamento médio entre os marcadores de 7,4 cM. Na análise de F2, em um único intervalo (LEI01,6-LEI01,4), compreendendo 28,8 cM, foram mapeados QTLs para todas as características estudadas, com exceção dos rendimentos de coração e pulmõe...
...opulation sizes of N <3,0 are not sufficient to obtain reliable maps, especially for those with a low degree of saturation, in which case there occurs an increase in inversions of molecular markers in linkage map. Maps less saturated showed lower genome recovery, lower estimates of correlation of Spearman and higher variance of distances between adjacent markers, especially for low level of PIC. As a genera...
...lacionais de N < 3,0 não são suficientes para a obtenção de mapas fidedignos, principalmente para mapas com baixo grau de saturação, quando ocorre um aumento relativo de inversões de marcas no mapa de ligação. Mapas menos saturados apresentaram menor recuperação de genomas, menores estimativas de correlação de Spearman e maiores variâncias das distâncias entre marcas adjacentes, principalmente para baixo nível de polimorfismo. Como conclusão geral, pode-se dizer que não é recomendável o uso d...
... was identified, which explained 28% of the variation of this trait. The genetic markers which explained a higher amount of the variation of the different traits evaluated were not allocated in the linkage map. Further studies are needed, which should target the increase of the map saturation level. This will probably allow the identification of other QTLs for the different traits analyzed....
...associado ao teor da isoflavona daidzina no grupo de ligação K, que explicou 28% desta característica. As marcas que mais explicaram as diferentes características avaliadas não foram alocadas no mapa de ligação e, estudos posteriores deverão ser conduzidos, visando aumentar o grau de saturação do mapa. Isto poderá permitir a identificação de QTLs para as diferentes características analisadas....
...ap® 3,0 software with microsatellite and AFLP markers. The QTL mapping followed two strategies: single locus analysis and multiple QTL models mapping (MQM). The linkage map resulted in 13 groups with 99 markers, and the map’s length was 842,35 cM with an average distance of 9,30 cM between the markers. The single locus analysis identified several QTL with small effects and one QTL (LOD=6,11) at the EMBRA1,5 mar...
...do com marcadores microssatélites e AFLP com auxílio do software JoinMap® 3,0. O mapeamento de QTLs seguiu duas abordagens: análise de marcas individuais e mapeamento múltiplo de QTLs (MQM). No mapa de ligação foram posicionados 99 marcadores em 13 grupos de ligação, totalizando 842,35 cM com distância média de 9,30 cM entre os marcadores. A análise de marcas individuais identificou vários QTLs de pequeno efeito e um QTL (LOD=6,11) localizado na posição do marcador EMBRA1,5 representando 20,8% da...
...QTL, independent from the saturation of the linkage group. In the second chapter, the linkage map differed from the expected one, when the selection intensity of the selective genotyping was 10% in many sceneries. At the other selection intensities, the recovery of the linkage map was possible as expected, even with distorted marks near to the simulated QTL. Concerning to QTL detection, the average values o...
...upo de ligação, são cenários que não permitem detectar facilmente o QTL. No segundo capítulo, quando a intensidade de seleção da genotipagem seletiva foi de 10%, em muitos cenários, o mapa de ligação obtido foi diferente do esperado. Nas outras intensidades de seleção foi possível a recuperação do mapa de ligação como esperado, mesmo com distorções das marcas próxima ao QTL simulado. Quanto à detecção do QTL, os valores médios dos LOD scores nas populações de 5,0, 3,0 e 2,0 indi...
...he present work aimed to characterize and identify QTL ́s for wood quality and growth characteristics in E. grandis x E. urophylla hybrids. For this purpose a RAPD linkage map was developed for the hybrids (LOD = 3 and r = 0,40), containing 52 markers and 12 linkage groups. For the map development, 1,6 RAPD markers from 63 random primers were used in a F1 full siblings population of 90 plants. Chara...
...ntificação de QTL ́s para características de crescimento e de qualidade da madeira em híbridos de eucalipto derivados do cruzamento E.grandis e E. urophylla. Para isto foi desenvolvido um mapa de ligação RAPD, pouco saturado, para os híbridos (LOD = 3 e r = 0,40) contendo 52 marcas e 12 grupos de ligação. Foram utilizados 90 indivíduos de população F1, “pseudotestcross” e 1,6 marcadores RAPD, a partir da amplificação com 63 oligonucleotídeos decâmeros de seqüência arbitrária. As ca...
...nt work aimed to characterize and identify QTLs for wood quality and growth traits in E. grandis x E. urophylla hybrids. For this purpose a RAPD linkage map was developed for the hybrids (LOD=3 and r=0,40) containing 52 markers and 12 linkage groups. Traits related to wood quality and growth were evaluated in the QTL analyses. QTL analyses were performed using chi-square tests, single-marker, interva...
...o de QTLs para características de crescimento e de qualidade da madeira em híbridos de eucalipto derivados do cruzamento entre E. grandis e E. urophylla. Para isso foi desenvolvido um mapa de ligação RAPD pouco saturado (LOD = 3 e r = 0,40) contendo 52 marcas e 12 grupos de ligação. Características de qualidade da madeira e características de crescimento foram avaliadas quanto à presença de QTLs. Foram utilizadas metodologias de mapeamento por marca simples, mapeamento por intervalo simpl...
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