Through the extraction, amplification and partial DNA sequencing of the ITS1 region of nuclear ribosomal DNA of those samples and the partial sequences of the ITS1 region of other bees of the same taxon searched in the GenBank, it was possible to observe the following parameters: multiple alignment, nucleotide composition, matrixes of genetic distances and phylogenetic reconstruction.
Por meio da extração, amplificação e seqüenciamento parcial da região ITS1 do DNA ribossômico nuclear dessas amostras, somadas às seqüências parciais da região ITS1 de outras abelhas do mesmo táxon retiradas do GenBank, pôde-se verificar os seguintes aspectos: alinhamento múltiplo, composição nucleotídica, matriz de distância genética e reconstrução filogenética entre as mesmas.
Banco de Glossários (traduções não verificadas)
Área
Inglês
Português
Qualidade
Biologia
ribosomal RNA
RNA ribossômico
Téc/Geral
ribosomal binding site
local de ligação ao ribossomo
Frases traduzidas contendo "ribosomal"
As amostras com qualidade adequada de RNA apresentavam íntegras as duas subunidades ribossomais: 18S e 28S.
The samples having a suitable amount of RNA showed integrity on both ribosomal subunits: 18S e 28S.
Through the extraction, amplification and partial DNA sequencing of the ITS1 region of nuclear ribosomal DNA of those samples and the partial sequences of the ITS1 region of other bees of the same taxon searched in the GenBank, it was possible to observe the following parameters: multiple alignment, nucleotide composition, matrixes of genetic distances and phylogenetic reconstruction.
Por meio da extração, amplificação e seqüenciamento parcial da região ITS1 do DNA ribossômico nuclear dessas amostras, somadas às seqüências parciais da região ITS1 de outras abelhas do mesmo táxon retiradas do GenBank, pôde-se verificar os seguintes aspectos: alinhamento múltiplo, composição nucleotídica, matriz de distância genética e reconstrução filogenética entre as mesmas.
The genomic DNA of the trematodes was extracted and amplified using primers targeted at the ribosomal (small ribosomal subunit - SSU gene- and internal transcribed spacer 1 - ITS1) and mitochondrial DNA (NDH dehydrogenase subunit 3 - ND3 gene- and cytochrome c oxidase subunit 1 – COI gene).
O DNA genômico dos trematódeos foi extraído e amplificado utilizando-se primers com alvo no DNA ribossomal (menor subunidade do DNA ribossomal - gene SSU - e região intergênica - ITS1) e DNA mitocondrial (nicotinamida dinucleotídeo dehidrogenase subunidade 3 - gene ND3 - e citocromo c oxidase subunidade I - gene COI).
The aim of this study is to evaluate the eIF5A dependence on ribosomal S6 kinase 2 protein (S6,2) translation, once S6,2 contains a poly-proline stretch on its C-terminus with five consecutive prolines (PPPPP).
Tendo em vista estas informações, o objetivo principal deste trabalho consiste no estudo da dependência de eIF5A na tradução da proteína ribosomal S6 kinase 2 (S6,2), pois a mesma apresenta em sua extremidade C-terminal uma região contendo cinco resíduos consecutivos de prolinas.
Additionally cytogenetic characterization of one population that occur in the Upper Magdalena Basin in Colombia was performed, using traditional techniques (Giemsa and NOR) and fluorescent hybridization in situ (FISH) through repetitive DNA probes, like microsatellites (CA 15 e GA 15 ) and ribosomal RNA multigene families (sondas 18S e 5S rDNA).
Adicionalmente, foi feita a caracterização citogenética de uma população que ocorre na bacia alta do rio Magdalena na Colômbia, empregando técnicas tradicionais (Giemsa e NOR) e de hibridação fluorescente in situ (FISH) usando sondas de DNA repetitivo, como microssatélites (CA 15 e GA 15 ) e as famílias multigênicas de RNA ribossomal (sondas 18S e 5S rDNA).
This study is a hypothesis test of whether Bryconinae of the eastern Brazilian coast are a phylogeographic unit, using standard cytogenetic techniques (Giemsa, argyrophylic-nucleolar organizer region -Ag-NORsdetection, and C-banding) and mitochondrial molecular markers (cytochrome oxidase subunit I COI- and mitochondrial ribosomal 16S) on Brycon devillei, Brycon ferox, Brycon insignis, Brycon opalinus e Brycon vermelha.
O objetivo deste trabalho foi testar a hipótese de existência de uma possível unidade filogeográfica dos Bryconinae que ocorrem nas bacias costeiras do leste brasileiro, uma região caracterizada pelo alto grau de endemismo, utilizando dados citogenéticos (coloração convencional, regiões organizadoras de nucléolos NORs e banda C) e moleculares mitocondriais (citocromo oxidase I e DNA ribossomal 16S).
Preferred compounds are those which bind to a ribosomal display system of the invention (which preferably comprises at least one ribosome, at least one specific scFv of the invention, and at least one mRNA encoding this scFv), without cross-reacting with (i.e., without binding to) another ribosomal display system, wherein said other ribosomal display system also comprises at least one ribosome, at least one antibody (for example, a scFv), and at least one mRNA encoding this antibody, but wherein said antibody (said scFv) binds to at least one neurotrophin, without binding to any of the modified neurotrophins that could be obtained from this at least one neutrophin.
Os compostos preferidos são aqueles que se ligam a um sistema de visualização ribossomal da invenção (que, de preferência, compreende ao menos um ribossomo, ao menos um scFv específico da invenção e ao menos um RNAm codificando esse scFv), sem realizar reação cruzada com (isto é, sem ligar-se a) outro sistema de visualização ribossomal, sendo que o referido outro sistema de visualização ribossomal também compreende ao menos um ribossomo, ao menos um anticorpo (por exemplo, um scFv) e ao menos um RNAm codificando esse anticorpo, mas em que o referido anticorpo (o referido scFv) se liga a ao menos uma neurotrofina, sem se ligar a nenhuma das neurotrofinas modificadas que poderiam ser obtidas a partir disto, ao menos uma neurotrofina.
Two alleles were identified as being associated with pathogenicity, one of which is located in the site encoding the non-ribosomal peptide synthetase - NRPS, which are associated with virulence of many pathogenic bacteria
Dois alelos foram identificados como associados a patogenicidade, sendo que um deles, , está localizado no loco que codifica a síntese de peptídeos não ribossomais (non ribosomal peptide synthetase – NRPS), os quais estão associados à virulência de muitas bactérias fitopatogênicas
One group with short and erect spines was identified as Pisolithus microcarpus, and the other with long and curved spines as Pisolithus marmoratus, after analyzing the cladogram obtained by phylogenetic relationship based on internal transcribed spacer (ITS) regions of the nuclear ribosomal DNA of these isolates.
Eles foram identificados, respectivamente, como Pisolithus microcarpus e Pisolithus marmoratus, depois da análise do cladograma obtido pela relação filogenética baseada no espaçador interno transcrito (ITS) do DNA ribossomal nuclear desses isolados.
The purpose of this study is to propose an alternative method to build phylogenetic trees using the fractal dimension calculated from (pseudo) random walks on mitochondrial DNA and ribosomal RNA of some species of living beings.
O objetivo deste trabalho é propor um método alternativo para construir árvores filogenéticas usando a dimensão fractal calculada a partir de caminhadas (pseudo) aleatórias realizadas sobre DNA mitocondrial e RNA ribossomal de algumas espécies de seres vivos.
In order to elucidate this question, analyses of two mitochondrial genes, cytochrome c oxidase subunit 1 (COI) and ribosomal RNA subunit (16S) were conducted.
Para elucidar essa questão, foram realizadas análises populacionais e filogenéticas utilizando-se dois genes mitocôndrias, citocromo c oxidase subunidade 1 região 3' (COI-3P) e subunidade ribossomal RNA 16S (16S).
It was noticed that the translation regulation of the gene can be affected by several factors, such as unstranslated regions (UTR), the mRNA structure, RNA-binding protein (RBPs) and ribosomal proteins.
Percebeu-se que a regulação de tradução do gene pode ser afetada por vários fatores tais como: regiões não traduzidas (UTRs), a estrutura de RNAm, proteína de ligação de RNA (RBP) e proteínas ribossomais.
Our phylogenetic analyses based on DNA sequence data from two nuclear ribosomal spacer regions (ITS and ETS) and three plastid regions (rps16 intron, and intergenic spacers psbA-trnH and trnL-trnF), including a comprehensive sampling of species of Simaba and closely related genera, show that Simaba as traditionally circumscribed is not monophyletic, with taxa segregated into two strongly supported but distinct clades.
Nossas análises filogenéticas baseadas em dados de sequências de DNA de duas regiões espaçadoras ribossômicas nucleares (ITS e ETS) e três regiões plastidiais (rps16 intron e espaçadores intergênicos psbA-trnH e trnL-trnF), incluindo uma amostragem abrangente de espécies de Simaba e gêneros proximamente relacionados, mostra que Simaba como tradicionalmente circunscrito não é monofilético, com os táxons segregados em dois clados fortemente sustentados e distintos.
Preferred compounds are those which bind to a ribosomal display system of the invention (which preferably comprises at least one ribosome, at least one specific scFv of the invention, and at least one mRNA encoding this scFv), without cross-reacting with (i.e., without binding to) another ribosomal display system, wherein said other ribosomal display system also comprises at least one ribosome, at least one antibody (for example, a scFv), and at least one mRNA encoding this antibody, but wherein said antibody (said scFv) binds to at least one neurotrophin, without binding to any of the modified neurotrophins that could be obtained from this at least one neutrophin.
Os compostos preferidos são aqueles que se ligam a um sistema de visualização ribossomal da invenção (que, de preferência, compreende ao menos um ribossomo, ao menos um scFv específico da invenção e ao menos um RNAm codificando esse scFv), sem realizar reação cruzada com (isto é, sem ligar-se a) outro sistema de visualização ribossomal, sendo que o referido outro sistema de visualização ribossomal também compreende ao menos um ribossomo, ao menos um anticorpo (por exemplo, um scFv) e ao menos um RNAm codificando esse anticorpo, mas em que o referido anticorpo (o referido scFv) se liga a ao menos uma neurotrofina, sem se ligar a nenhuma das neurotrofinas modificadas que poderiam ser obtidas a partir disto, ao menos uma neurotrofina.
The activation of this immune receptor leads to phosphorilation of the ribosomal protein L10 (RPL10) and in the subsequent nuclear relocation of this ribosomal protein.
A ativação deste receptor imune resulta na fosforilação da proteína ribossomal L10 (RPL10) e na subsequente relocação nuclear desta proteína ribossomal.
From 5 x 1,5 transformants screened, two clones, encoding AtEXL3 (Exordium Like 3), a cell wall protein, and AtRPS5A, ribosomal protein S5A, displayed histidine/adenine auxotrophy and activate LacZ expression, on X-gal indicator plates.
De um total de 5 x 1,5 transformantes escrutinados, dois clones, codificando EXL3 (Exordium Like 3), uma proteína de parede celular, e RPS5A, proteína ribossomal S5A, apresentaram auxotrofia a histidina e expressão do gene repórter LacZ, em placas indicadoras de X-gal.
The data obtained by MS allowed the identification of the protein spots associated with mercury, revealing proteins involved in energy metabolism (glyceraldehyde-3-phosphate, malate and Llactate dehydrogenase, enolase, creatine kinase and phosphoglycerate mutase), transport (α and β hemoglobins, fatty acid binding proteins and GTPases), synthesis and degradation of proteins (ubiquitin and ribosomal S27a and ribosomal 40S S24), cell differentiation (nucleoside diphosphate kinase), gene regulation (pterin-4-α-carbinolamine dehydratase and histone H4), immune defense (natural killer cell enhancement factor), calcium metabolism (β-parvalbumin), adipogenesis (UPF03,6), xenobiotic metabolism and steroidogenesis (cytochrome P4,0scc) and antioxidant system (Glutathione peroxidase, glutathione-S-transferase, superoxide dismutase, catalase and aldehyde dehydrogenase).
Os dados obtidos por MS possibilitaram a identificação dos spots proteicos associados ao mercúrio, revelando proteínas envolvidas no metabolismo energético (gliceraldeído-3-fosfato, malato e Llactato desidrogenase, enolase, creatina quinase e fosfoglicerato mutase), transporte (hemoglobinas α e β, proteínas de ligação a ácidos graxos e GTPases), síntese e degradação de proteínas (ubiquitina e ribossomal S27a e ribosomal 40S S24) diferenciação celular (nucleosídeo difosfato quinase), regulação gênica (pterina-4-α-carbinolamina desidratase e histona H4), defesa imunitária (fator de aprimoramento de células natural killer), metabolismo do cálcio (parvalbumina β), adipogênese (UPF03,6), metabolismo de xenobióticos e esteroidogênese (citocromo P4,0scc) e sistema antioxidante (glutationa peroxidase, glutationa-S-transferase, superóxido dismutase, catalase e aldeído desidrogenase).
Furthermore, studies related to the karyotype evolution in the species G. carapo and G. sylvius, location of ribosomal genes and molecular analysis of both 5S ribosomal gene and its non-transcribed spacer were performed to provide a better comprehension about the evolution of this gene family in Gymnotus.
Foram efetuados ainda, estudos envolvendo a evolução cariotípica das espécies G. carapo e G. sylvius, localização de genes ribossômicos e análise molecular do gene ribossômico 5S juntamente com seu espaçador não transcrito, propiciando uma melhor compreensão da evolução dessa família gênica em Gymnotus.
Sequences of the ribosomal 16S gene and cytochrome oxidase 1 were obtained from parasite specimens collected in six amazon sub-basins.
Sequências dos genes ribossomal 16S e citocromo oxidase 1 foram obtidas para espécimes de parasitas de seis sub-bacias amazônicas.
We have previously identified that NIK activation mediates an indirect phosphorylation of the ribosomal protein L10 causing the translocation of the cytosolic protein to the nucleus, where it interacts with LIMYB (L10-interacting Myb domain-containing protein) to regulate genes involved in the translation machinery resulting in a global translation suppression.
Previamente, foi identificado que a ativação de NIK medeia a fosforilação indireta da proteína ribossomal L10, promovendo a translocação da proteína citosólica para o núcleo, onde interage com a proteína LIMYB (L10-interacting Myb domain-containing protein), para regular genes envolvidos na maquinaria de tradução da célula, resultando em supressão da tradução global.
No sex-specific patterns of methylation, however, were detected in the ribosomal DNA of the species D. melanogaster and D. paulistorum.
Entretanto, não detectamos padrões de metilação sexo-específicos para o DNA ribossomal das espécies D. melanogaster e D. paulistorum.
These isolates were identified by 16S ribosomal DNA sequence analysis as Acinetobacter johnsonii (UFV-E05), Serratia marcescens (UFV-E13), Sinorhizobium sp. (UFV-E25) and Bacillus megaterium (UFV-E26).
Esses isolados foram identificados, por meio do sequenciamento do gene 16S do DNA ribossômico, como Acinetobacter johnsonii (UFV-E05), Serratia marcescens (UFV-E13), Sinorhizobium sp. (UFV-E25) e Bacillus megaterium (UFV-E26).
From new multilocus and single gene matrices of ribosomal markers, different analyses were created to infer and evaluate phylogenies, as well as to define and establish the impact of used methods on data treatment and nodal support to Hydrozoa, and more specifically, Leptothecata.
A partir de matrizes multilocus e individuais gênicas de marcadores ribossomais, foram realizadas diferentes análises para inferir e avaliar filogenias, assim como também para definir e estabelecer o impacto dos métodos utilizados na qualidade dos estudos filogenéticos desenvolvidos para Hydrozoa em geral, e Leptothecata de forma específica.
With the advance of the molecular biology techniques, using the gene encoding the 16S subunit of the ribosomal RNA, the study of microbial communities that would not be accessed by traditional methods of cultivation was enabled.
Com o avanço da biologia molecular, suas técnicas de estudo de diversidade utilizando o gene do rRNA 16S, houve a oportunidade de se estudar comunidades microbianas que não seriam acessadas por métodos de cultivos tradicionais.
Among the sequences similar to genes that encode proteins with known functions, there was a larger number of genes that encode ribosomal proteins, followed by the group of genes that encode proteins involved in primary metabolism and energy
production, and 27 sequences showed similarity to genes that encode proteins
related to defense process such as WRKY transcription factors, protein kinases,
phosphatases, metallothionein, PRs, chitinases, beta-1 ,3-glucanase, enzymes
such as phenylalanine ammonia-lyase, glutathione S-transferase.
Dentre as sequências com similaridade a genes que codificam proteínas com funções conhecidas, verificou-se maior número de genes que codificam proteínas ribossomais, seguido do grupo de genes que codificam proteínas envolvidas no metabolismo primário e produção de energia, sendo que 27 sequências apresentaram similaridade a genes que codificam proteínas relacionadas ao processo de defesa tais como os fatores de transcrição WRKY, proteínas cinases, fosfatases, metalotioneína, PRs, quitinases, beta-1,3- glucanase, enzimas como fenilalanina-amônia liase, glutationa S-transferase.
in this module, we assessed the composition of soil microbiome (bacterial, fungal and protist) using a high-throughput sequencing approach (16S and 18S ribosomal markers), the population of parasitic and free-living nematodes, the plant productivity and its interrelationships in a long-term experiment dividing conventional and organic systems into alternative methods for plant pathogen control.
Neste estudo, avaliamos a composição do microbioma do solo (bactérias, fungos e protistas), utilizando o sequenciamento de nova geração (marcadores ribossômicas 16S e 18S), a população de nematoides de vida livre e parasitas, a produtividade da planta e sua inter-relações em um experimento de longa duração dividindo sistema convencional e orgânico em métodos alternativos de controle de patógenos de plantas.
The DAPI + -CMA 3+ patterns diverged from what was found for the tribe and repetitive DNA sequences hybridized only to euchromatin regions; (iii) Melipona (Melikerria) interrupta presented 2n=18 chromosomes, high heterochromatin content, CMA3 + and 18S ribosomal DNA were observed in the interstitial region near the junction of euchromatin and heterochromatin of the first chromosomal chromosomal pair; (iv) Melipona has species with a conserved chromosome number (2n=18) and the heterochromatin regions are important markers for separating the species from Group I and II as well as DAPI-CMA3 + and 18S. Repetitive DNA probes were restricted to chromosomes’ euchromatin with distinct distribution patterns between low and high heterochromatin species.
Os padrões de DAPI + - CMA 3+ divergiram do encontrado para a tribo e as sequências de DNA repetitivo hibridizaram apenas em regiões de eucromatina; (iii) Melipona (Melikerria) interrupta apresentou 2n=18 cromossomos, alto teor de heterocromatina, marcações do CMA3 + e DNA ribossomal 18S foram observadas na região intersticial próxima a junção da eucromatina e heterocromatina do primeiro par cromossômico cromossômico; (iv) Melipona possui espécies com número cromossômico conservado (2n=18) e as regiões de heterocromatina são importantes marcadores para separar as espécies do Grupo I e II, assim como o DAPI-CMA 3+ e o 18S. As sondas de DNA repetitivos foram restritas à eucromatina dos cromossomos, com padrões de distribuição distintos entre as espécies de baixo e alto teor de heterocromatina.
In the present study, the biochemical and functional characterization of two ribosomal proteins, L10 and L18 were described, these being capable of interacting with the protein NIK via the yeast two-hybrid system.
No presente estudo foi descrita a caracterização bioquímica e funcional de duas proteínas ribossomais, L10 e L18, as quais foram capazes de interagir com a proteína NIK através do sistema de duplo híbrido de leveduras.
The cytogenetic results obtained indicate that this group of species can be defined by the presence of sex chromosomes differentiated ZZ / ZW carrying ribosomal cistrons and the presence of a relatively stable karyotype.
Os resultados citogenéticos encontrados indicam que esse grupo de espécies pode ser definido pela presença de cromossomos sexuais diferenciados do tipo ZZ/ZW portadores de cístrons ribossomais e pela presença de um cariótipo relativamente estável.
The membrane was reprobed with ribosomal DNA to check for equal loading of RNA samples.
A membrana foi sondada novamente com DNA ribossômico para verificar o carregamento igual das amostras de RNA.
The presence of major metabolites such as alanine, myo-inositol, taurine, choline, glicerofosfocolina, cadaverine, glutamate, glutamine, lactate, hydrouracile, creatine, creatinine, aspartate and lysine, proteins such as tubulin and actin cytoskeleton, histone, subunits of hemoglobin, HSP-β1, ribosomal protein, vimentin, markers of extracellular matrix, alpha-1-fetoprotein and transferrin.
A presença de importantes metabolitos como a alanina, mio-inositol, taurina, colina, glicerofosfocolina, cadaverina, glutamato, glutamina, lactato, hidrouracila, creatina, creatinina, aspartato e lisina; e proteínas como filamentos de actina ou tubulina do citoesqueleto, histona, sub unidades da hemoglobina, HSP-β1, proteína ribossomal, marcadores da matrix extracelular vimentina, alfafetoproteina e transferrina.
The data consist of electrophoresis in a gel images obtained from PCR-RFLP analysis of 3 ribosomal regions: 16S, 23S e IGS. They were digested with 3 restriction endonuclease: CfoI, MspI and DdeI. This work presented some algorithms which can help in taxonomic studies of Bradyrhizobium strains using electrophoresis in a gel images.
Os dados consistem de imagens de gel de eletroforese obtidas a partir da análise RFLP-PCR de 3 regiões ribossomais: 16S, 23S e IGS. Foram utilizadas as enzimas de restrição: Cfo I, Dde I, Msp I, Hae III, Hha I e Hinf I. Este trabalho apresentou algoritmos que podem auxiliar no estudo taxônomico de estirpes de Bradyrhizobium a partir de imagens de gel de eletroforese.
HCV also encodes small proteins, called F (frame shift) or ARFP (alternative reading frame protein), that can be produced by ribosomal frame shifting or internal initiation into an alternative +1 reading frame within the core gene (see Branch et al., 20,5, Semin.
O VHC também codifica proteínas pequenas, chamadas de F (deslocamento do quadro de leitura, ou frame shift) ou ARFP (proteína do quadro de leitura alternativo), que podem ser produzidas pelo deslocamento do quadro ribossômico ou pela iniciação interna em um quadro de leitura +1 alternativo dentro do gene núcleo (vide Branch e col., 20,5, Semin.
To this end, we used transgenic Arabidopsis plants expressing tagged ribosomes, specifically, the constructs harboring coding sequences of direct cell-type specific expression of FLAG-tagged ribosomal protein L18 (RPL18) that are under the control of (i) cauliflower mosaic virus 35S promoter (p35S - near constitutive), (ii) SCARECROW (pSCR – targeting cells at root endodermis and quiescent center), and (iii) endopeptidase (pPEP – targeting cells at root cortex elongation and maturation zone).
Buscou-se, também, investigar se o perfil de metabólitos na raiz inteira está mais intimamente correlacionado às análises de expressão gênica observadas nas células corticais, comprometidas com a proteção do órgão, ou nas células do centro quiescente, comprometidas com a sobrevivência e a manutenção da identidade das demais células.
...s complex has representatives with variations related to morphology and mainly, to the karyotype macrostructure. Polymorphisms are observed in terms of diploid number, karyotype formulas, location of ribosomal genes and presence of sex chromosome systems. A population of the Paranapanema river, Hypostomus aff. ancistroides, has peculiar characteristics: reduced chromosome number, small morphological differ...
...ntantes com variações relacionadas à morfologia e principalmente, à macroestrutura cariotípica. São observados polimorfismos quanto ao número diploide, fórmulas cariotípicas, localização de genes ribossomais e presença de sistemas cromossômicos sexuais. Uma população do rio Paranapanema, Hypostomus aff. ancistroides, apresenta características peculiares: número cromossômico reduzido, pequenas diferenças morfológicas, monofiletismo quando comparada às outras populações e ainda, a ex...
...Bank and RDP databases revealed the isolates belonged to the genera Marinobacter and Halomonas. Comparing these results with those obtained by classical taxonomic techniques demonstrated that the 16S ribosomal RNA gene analysis (culture independent method), found greater diversity. Finally, of all tests performed to bioremediate the produced water, biostimulation by addition of nutrients was the most effec...
...ias do gene RNA ribossomal 16S presente nos bancos de dados GenBank e RDP revelou a presença de micro-organismos pertencentes aos gêneros Marinobacter e Halomonas e na comparação da técnica clássica de isolamento com a técnica independente de cultivo (biblioteca do gene RNA ribossomal 16S), foi encontrada uma maior diversidade na última. Finalmente de todos os testes realizados na tentativa de biorremediar a água de produção de petróleo, a bioestimulação foi a mais efetiva, sendo conseguida...
...cal activities. Streptomyces are the most important genera studied. Such microorganisms carries out among a variety of biosynthetic enzimes, two main groups known as polyketide synthase (PKS) and non ribosomal peptide synthetase (NRPS), both catalyzing the biosynthesis of polyketide and non ribosomal peptides respectively. PKS and NRPS biosynthesis follows a collinear relationship among the gene cluster, t...
... possuem dentre outros, dois grupos de enzimas multimodulares conhecidas como policetídeo sintase (PKS) e peptídeo não ribossomal sintetase (NRPS) que catalisam a produção de policetídeos e peptídeos não ribossomais respectivamente. A biossíntese destas moléculas se dá geralmente seguindo uma relação linear entre o gene, a enzima e a estrutura da molécula. Desta forma, com o conhecimento das sequências do gene é possível prever a molécula a ser produzida e sua manipulação amplia a pos...
...t, the livers were removed and used for immunoblotting or histological analysis. The phosphorylation of the protein kinase B (pAkt; Ser4,3), mammalian target of the rapamycin (pmTOR; Ser24,8), 70-kDa ribosomal protein S6 kinase 1 (pS6,1; Thr3,9) and AMP-activated protein kinase (pAMPK; Thr1,2) were significantly higher in the OTR/down group when compared to the CT and OTR groups. The phosphorylation of the...
...utilizados para immunoblotting ou análises histológicas. A fosforilação da proteína kinase B (pAkt; Ser4,3), mammalian target of the rapamycin (pmTOR; Ser24,8), 70-kDa ribosomal protein S6 kinase 1 (pS6,1; Thr3,9) e da AMP-activated protein kinase (pAMPK; Thr1,2) foram significativamente maiores no grupo OTR/down quando comparado com os grupos CT e OTR. A fosforilação da 4E-binding protein-1 (p4E-BP1; Thr37,46) foi significativamente maior no grupo OTR/down quando comparado com o grupo CT&p...
... algorithms built in Perl language. The genes involved in some kind of alternative splicing are associated with various metabolic functions such as translation, vesicular transport, lipid metabolism, ribosomal biogenesis, DNA binding sequence, transcription regulation and processing of pre-mRNA. These results contribute to increase the knowledge of the molecular mechanisms involved in the survival r...
...erl. Os genes envolvidos em algum tipo de processamento alternativo estão relacionados com funções metabólicas variadas como tradução, transporte vesicular, metabolismo lipídico, biogênese ribossomal, sequência de ligação ao DNA, regulação da transcrição e processamento do pré-mRNA. Estes resultados contribuem para uma melhor compreensão dos mecanismos moleculares envolvidos na resposta de sobrevivência perante a exposição ao AUN....
...rged fermentation. The fermentation was made using synthetic medium by sucrose and molasses to reduce the costs in the process. Four strains was selected and identified by molecular methodology using ribosomal gene 16S for de bacterium and 18S for the fungi. Two filamentous fungi were identified as Penicillium sp., one unicellar fungi as Aureobasidium pullulans and one bacterium as Bacillus sp. All selecte...
...io sintético de sacarose e a base de melaço de cana com o intuito de utilizar um substrato alternativo e de baixo custo para o processamento. Foram selecionadas quatro linhagens, as quais foram identificadas pela metodologia molecular do gene ribossomal 16S para bactéria e 18S para os fungos. Dois fungos filamentosos foram identificados como Penicillium sp, um fungo unicelular como Aureobasidium pullulans e uma bactéria como Bacillus sp. Todas as linhagens selecionadas apresentaram altos rendimentos ...
...n by their capacity to transform the nitrogen ('N IND.2') of the atmosphere into nitrogen compounds useful for the host plants. This dataset is formed by genetic data resulting of the analysis of the ribosomal RNA. The results shown that the hierarchical Bayesian clustering method built dendrograms with good quality, in some cases, better than the other hierarchical methods. In the method based in c...
...es de bactérias do gênero Bradyrhizobium (conhecidas por sua capacidade de fixar o 'N IND.2' do ar no solo). Este banco de dados é composto por dados genotípicos resultantes da análise do RNA ribossômico. Os resultados mostraram que o método hierárquico Bayesiano gera dendrogramas de boa qualidade, em alguns casos superior que o melhor dos algoritmos hierárquicos analisados. O método baseado em redes gaussianas condicionais também apresentou resultados aceitáveis, mostrando um adequado aprove...
...lation between eIF5A and the alanine tRNA (tRNAAla), revealed as a genetic interaction in Saccharomyces cerevisiae, and also evaluated the effect of eIF5A in events of protein synthesis as Programmed ribosomal frameshifting (PRF), misincorporation and readthrough using dual luciferase reporters. First, the allele specificity of the high copy suppression caused by tRNAAla and the ability of tRNAs for other ...
... eIF5A no processo de tradução, o presente trabalho de doutorado estudou a relação funcional entre eIF5A e o tRNA de alanina (tRNAAla), revelada como uma interação genética em Saccharomyces cerevisiae, assim como avaliou a relação de eIF5A com eventos da síntese proteica como Programmed Ribosomal Frameshifting (PRF), misincorporation e readthrough, utilizando repórteres de duas luciferases. Primeiramente, foi analisada a especificidade alélica da supressão em alto número de cópias ocasiona...
... databases, using Ion Trap and QTOF analyzers. By KOG, the classes of proteins analyzed in the midgut of the males and females ticks are involved in the chromatin structure and dynamics, translation, ribosomal structure and biogenesis, post- translational modification, protein turnover and chaperones, cytoskeleton, energy production and conversion, metabolism and transport of carbohydrates, lipids and inor...
... de dados Oryctolagus, utilizando os analisadores Ion Trap e QTOF. Pelo KOG, as classes das proteínas analisadas no intestino dos carrapatos machos e fêmeas que se destacaram estão envolvidas na dinâmica e estrutura da cromatina, tradução, biogênese e estrutura ribossomal, modificação pós-traducional, turnover proteico, chaperonas, citoesqueleto, conversão e produção de energia, metabolismo e transporte de carboidratos, lipídeos e íons inorgânicos. Na identificação das proteínas...
...in the invertebrate moleria Galleria mellonella. A total of 28 strains of M. pachydermatis were isolated and identified by the sequencing of the Internal Transcribed Spacer - ITS region of the ribosomal DNA. The antifungal activity test revealed that ketoconazole, miconazole and posaconazole showed low MICs for the clinical isolates of M. pachydermatis. However, some clinical isolates ...
...ngica dos óleos essenciais de Alecrim pimenta, Cravo-da-Índia, Menta, Tomilho branco, Manjericão, Alecrim e Limão-Tahiti. Adicionalmente, a toxicidade dos óleos essenciais foi avaliada no modedo invertebrado Galleria mellonella. Um total de 28 cepas de M. pachydermatis foram isoladas e identificadas pelo sequenciamento da região Internal Transcribed Spacer (ITS) do DNA ribossomal. O teste de atividade antifúngica revelou que cetoconazol, miconazol e posaconazol apresentaram baixa concentra...
...um (Mannitol-Egg-yolk Polymixyn) and 24 isolates were confirmed as of B. cereus by morphological, biochemical tests and also by genetic identification, by conventional PCR for detection of 16S ribosomal RNA, which corresponds a prevalence of B. cereus of 29%. Ultra Rice® had the highest number of samples (11) containing isolates of B. cereus, followed by rice added of vitamins and min...
...sentaram isolados típicos de B. cereus em meio MYP (Manitol-Egg Yolk-Polymixyn) e 24 isolados foram confirmados pelos testes morfológicos, bioquímicos e, também, pela identificação genética, realizada pela técnica de PCR convencional para a detecção do gene 16S ribossomal do B. cereus, o que corresponde a prevalência de 29% de B. cereus. O arroz Ultra Rice® apresentou o maior número de amostras (11) contendo isolados de B. cereus, seguido do arroz vitaminado (9) e...
...ddition of the pollutant in time of 15 minutes, 1, 2, 3 and 5 hours and during the log phase bacterial growth, respectively. The quality of total RNA was measured by the integrity of the fragments of ribosomal RNA (rRNA) checked by electrophoresis on 1,2% agarose gel and the ratio between the absorbances at 2,0 nm and 2,0 nm. For quantitative and qualitative analysis of proteins, the method of Bradford and...
...28 ºC. A extração de RNA e proteínas totais foi feita após a adição do poluente no tempo de 15 minutos, 1, 2, 3 e 5 horas e durante a fase log do crescimento bacteriano, respectivamente. A qualidade do RNA total foi mensurada pela integridade dos fragmentos de RNA ribossômico (rRNA) verificado por eletroforese em gel de agarose 1,2% e pela relação entre as absorbâncias a 2,0 nm e 2,0 nm. Para análise quantitativa e qualitativa das proteínas foi utilizado o método de Bradford e SDS-PA...
...l new host records linked to known cercosporoid in Brazil. Additionally, the phylogenetic position of Camptomeris leucaenae was investigated for the first time based in sequences of the large subunit ribosomal (LSU). This study confirmed that C. leucaenae belongs to Mycosphaerellaceae s. str. (Capnodiales, Dothideomycetes) and is closely related to Cymadothea trifolii a pathogen a native leguminous ...
...presentando novas associações com cercosporoides de ocorrência já conhecida anteriormente no Brasil. Adicionalmente, o posicionamento filogenético de Camptomeris leucaenae foi investigado pela primeira vez baseado em sequências da região LSU. Confirmou-se que C. leucaenae pertence à família Mycospaerellaceae (Capnodiales, Dothideomycetes), situando-se próximo de Cymadothea trifolii, patógeno de uma leguminosa nativa da Europa. O presente estudo é uma contribuição para uma abor...
...tive taxonomy highlights the importance of integrating data from different areas of science to assist the delimitation of species. Molecular cytogenetic data that have used FISH to physically map the ribosomal genes of Neotropical ants are scarce, and such data are available for only 25 species. Most species showed a single pair of NOR bearers, except Dinoponera gigantea and Camponotus renggeri. These gene...
...dencia a importância da integração de dados de diversas áreas da ciência para auxiliar na delimitação de espécies. Dados citogenéticos moleculares empregando FISH para localização de genes ribossomais em formigas neotropicais são escassos e disponíveis apenas para 25 espécies. A maioria das espécies apresentou um par cromossômico carreador desses genes, exceto Dinoponera gigantea e Camponotus renggeri. Esses genes mostraram-se ricos em pares de bases GC em praticamente todas as espécies,...
... culture with the domain of gram-negatives cocci, average diameter of 1,8 mm, nonspore-forming and desulfoviridin positive. These cells were identified as Desulfococcus multivorans through the use of ribosomal 16S DNA sequencing technique. This biomass was submitted to physiological tests aiming to characterize the growth with different electron acceptors and organic substrates. It was possible to verify t...
...ra com predomínio de cocos, gram-negativos, diâmetro médio de 1,8 mm, não formadores de esporos e desulfoviridina positiva. Sendo identificadas como Desulfococcus multivorans através de seqüenciamento do DNAr 16S. As células foram submetidas a testes fisiológicos visando caracterizar o crescimento com diferentes aceptores de elétrons e substratos orgânicos. Nas condições em que predominaram cocos o consumo das fontes de carbono foram melhores quando as fontes aceptoras de elétron eram...
...osteological and external morphological characters. In the present study, simultaneous analysis of 21,9 aligned base pairs from the mitochondrial 16S and ATPase and the nuclear first intron of the S7 ribosomal protein were analyzed for the species A. microlepis, A. falcatus, A. heterolepis, A pantaneiro, A. falcirostris, A. altus, A. minimus, A. grandoculis,...
... na análise de 1,4 características osteológicas e de morfologia externa. No presente estudo, 21,9 pares da região 16S e da ATPase, ambos do genoma mitocondrial, juntamente o primeiro íntron da proteína ribossomal S7 do genoma nuclear, foram analisados para as espécies A. microlepis, A. falcatus, A. heterolepis, A pantaneiro, A. falcirostris, A. altus, A. minimus, A. grandoculis, A. britskii, A. lacustris e A. nasutus. Os gênero...
...entified the presence and viability of Streptococcus spp., Enterococcus faecalis and Propionibacterium acnes before and after endodontic procedures, using the polymerase chain reaction (PCR) based on ribosomal RNA (rRNA) and their genes (rDNA ). Samples of 20 teeth with primary infection were collected before (S1) and after chemical-surgical preparation (S2), and after Ca(OH)2 as temporary dressing (S3). D...
...lidade de Streptococcus spp., Propionibacterium acnes e Enterococcus faecalis antes e após os procedimentos endodônticos, utilizando o método de reação de cadeia de polimerase (PCR) baseado em RNA ribossômico (rRNA) e seus respectivos genes (rDNA). Foram coletadas amostras de 20 dentes com infecção primária antes (S1) e após o preparo químico-cirúrgico (S2), e depois do emprego do Ca(OH)2 como medicação intracanal (S3). DNA e RNA foram extraídos da mesma amostra de canal radicular e ut...
Inglês
Português
Resultados da busca para 
